Nyckelskillnaden mellan NAAT och PCR är att NAAT är en som amplifierar genetiskt material på flera sätt, inklusive polymeraskedjereaktion, strängförskjutning eller transkriptionsmedierad amplifiering, medan PCR är en metod som amplifierar genetiskt material genom att endast använda termisk cykling.
Patogener identifieras huvudsakligen genom amplifiering av deras genetiska material. De flesta av teknikerna inom detta område fokuserar på detektion av patogenens genetiska material genom att amplifiera specifika sekvenser i re altid. Därför produceras resultaten mycket snabbt i det diagnostiska sammanhanget. NAAT, PCR, biosensor och LCR är flera tekniker som används i laboratorier för att amplifiera patogenens genetiska material.
Vad är NAAT?
Nukleinsyraamplifieringstest (NAAT) är en metod inom molekylärbiologi som amplifierar genetiskt material på flera sätt som polymeraskedjereaktion, strängförskjutningsamplifiering eller transkriptionsmedierad amplifiering. Amplifiering av genetiskt material kan också göras genom tekniker som en ligeringskedjereaktion och grenad DNA-reaktion (kvantiplex b-DNA) i NAAT-proceduren. NAAT använder specificiteten för Watson-Crick basparning. I NAAT-proceduren hybridiseras en enkelsträngad sond eller primermolekyl med mål-DNA- eller RNA-molekylen. Därför är utformningen av sondsträngen mycket betydelsefull för att förbättra känsligheten och specificiteten för detektionen. Sedan förstärker nästa steg i NAAT det genetiska materialet genom att göra många kopior av det för upptäckt.
Figur 01: NAAT
NAAT används för närvarande för detektion av flera patogener som Neisseria gonorrhea, Chlamydia trachomatis, Mycobacterium tuberculosis och SARS-COV2. Dessutom är NAAT-testet utvecklat för att förkorta fönsterperioden. Fönsterperioden är tidsperioden mellan det att en patient har blivit smittad och när de visar sig som positiva av antikroppstester. Dessutom godkändes NAAT-screeningsmetoden först 1999 av FDA. NAAT har många fördelar, inklusive detektering av låga nivåer av DNA eller RNA, hög känslighet och hög specificitet.
Vad är PCR?
PCR är en metod inom molekylärbiologi som förstärker genetiskt material med enbart termisk cykling. PCR står för polymeraskedjereaktion. Det är ett test för att upptäcka genetiskt material från en specifik organism som bakterier, svampar och virus. Vid sjukdomsdiagnostik upptäcker PCR närvaron av en patogen om personen har en patogen vid tidpunkten för testet. Vid sjukdomsdiagnostik har PCR-protokollet flera steg, inklusive provtagning, DNA-extraktion, PCR och sekvensering. Vid testning av patogener används det insamlade provet för att extrahera genetiskt material (DNA eller RNA). PCR-proceduren kräver speciella kemikalier, primers och enzymer för att producera miljontals kopior av genetiskt material inuti PCR-maskinen som kallas termisk cykler. När den väl amplifierats från PCR-produkten kan patogenen detekteras. Forskare använder speciell programvara för att tolka resultaten.
Figur 02: PCR
Dessutom finns det olika typer av PCR som för närvarande används i forskningen. RT-PCR, Multiplex PCR, RAPD och Nested PCR är flera bland dem. PCR är användbar speciellt vid detektion av faryngit (streptokockfaryngit), atypisk lunginflammation (Chlymydia pneumoniae), mässling (Morbillivirus), hepatit (HBV) och ulcerös urogenital infektion (Haemophilus ducreyi).
Vilka är likheterna mellan NAAT och PCR?
- NAAT och PCR är två viktiga molekylärbiologiska metoder som används för att amplifiera genetiskt material.
- Nukleinsyror (DNA eller RNA) amplifieras med båda teknikerna.
- De är snabba och snabba tekniker.
- Båda teknikerna används för närvarande för sjukdomsdiagnostik.
- De är dyra än konventionella metoder.
Vad är skillnaden mellan NAAT och PCR?
NAAT är en metod inom molekylärbiologi som förstärker genetiskt material med flera metoder, medan PCR är en metod inom molekylärbiologi som förstärker genetiskt material med enbart termisk cykling. NAAT använder olika tekniker för amplifiering av genetiskt material såsom polymeraskedjereaktion, strängförskjutningsamplifiering, transkriptionsmedierad amplifiering, ligeringskedjereaktion och grenad DNA-reaktion (kvantiplex b-DNA). Å andra sidan använder PCR olika tekniker för amplifiering av genetiskt material såsom RT-PCR. Multiplex PCR, RAPD, Nested PCR. Så detta är den viktigaste skillnaden mellan NAAT och PCR.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan NAAT och PCR i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – NAAT vs PCR
Det finns olika molekylärbiologiska verktyg som används i laboratorier för att förstärka genetiskt material. NAAT, PCR, biosensor och LCR är flera sådana tekniker. NAAT är en molekylärbiologisk teknik som amplifierar genetiskt material med hjälp av flera sätt som polymeraskedjereaktion, strängförskjutning eller transkriptionsmedierad amplifiering. PCR är en metod inom molekylärbiologi som förstärker genetiskt material med hjälp av termisk cykling. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan NAAT och PCR.
