Nyckelskillnaden mellan DNA-transposoner och retrotransposoner är att DNA-transposoner är mobila genetiska element som rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en klipp- och klistramekanism, medan retrotransposoner är mobila genetiska element som rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda kopierings- och klistramekanismen.
Mobila genetiska element (MGE) är segment av DNA som kodar för specifika enzymer och proteiner som förmedlar deras rörelse inom genomet, eller som kan överföras från en art till en annan. De är också kända som själviska genetiska element. Transponerbara element representerar en av flera typer av mobila genetiska element. Det finns två huvudtyper av transposerbara element: DNA-transposoner och retrotransposoner. Därför är DNA-transposoner och retrotransposoner mobila genetiska element som kan röra sig från plats till plats i genomet.
Vad är DNA-transposoner?
DNA-transposoner är mobila genetiska element som rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en klipp- och klistramekanism. De tillhör klass II transposerbara element som rör sig genom en DNA-mellanprodukt. Detta är i motsats till klass I-transposerbara element (retrotransposoner) som rör sig genom en RNA-mellanprodukt. Norm alt rör sig DNA-transposoner runt i arvsmassan genom att använda en klipp- och klistrametod. Denna metod kräver ett transposasenzym som katalyserar rörelsen av DNA från dess nuvarande plats i genomet och insättning på den nya platsen.
Figur 01: DNA-transposoner
Denna transposition kräver tre DNA-ställen på transposonet (två i varje ände av transposonet kallas terminala inverterade upprepningar och en vid målplatsen). Transposasenzymet kommer att binda till de terminala inverterade upprepningarna av transposonet och förmedlar synapsis av transposonändarna. Sedan kopplar transposasenzymet elementet från det flankerande DNA:t från det ursprungliga donatorstället och förmedlar sammanfogningen av transposonet till det nya insättningsstället i genomet. Tillägget av transposon till den nya platsen orsakar korta luckor på vardera sidan av det införda segmentet. Värdsystem reparerar dessa luckor, vilket resulterar i målsekvensduplicering (TSD), som är karakteristisk för transposition.
Vad är retrotransposoner?
Retrotransposoner är mobila genetiska element som rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en kopierings- och klistramekanism. De tillhör klass I-transponerbara element. Klass I-transposerbara element (retrotransposoner) rör sig genom en RNA-intermediär i genomet. De är en typ av genetisk komponent som kopierar och klistrar in sig själva på olika genomiska platser.
Figur 02: Retrotransposoner
Först transkriberas de från DNA till RNA. Sedan transkriberas det producerade RNA:t till DNA. Detta kopierade DNA sätts senare in i genomet på en ny plats. Den omvända transkriptionen katalyseras av omvänt transkriptas. Omvänt transkriptas kodas ofta av retrotransposon själv. Integrationen utförs av ett enzym som kallas integras. Dessutom finns det vanligtvis tre typer: långa terminalupprepningar (LTR), långa interspersed nukleära element (LINE) och korta interspersed nuclear element (SINE).
Vilka är likheterna mellan DNA-transposoner och retrotransposoner?
- DNA-transposoner och retrotransposoner är mobila genetiska element.
- Båda klassificeras under transponerbara element.
- Båda är kända som hoppgener.
- De kan flytta från plats till plats i arvsmassan.
- De är evolutionära mycket viktiga.
Vad är skillnaden mellan DNA-transposoner och retrotransposoner?
DNA-transposoner är mobila genetiska element som flyttar sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en klipp- och klistramekanism, medan retrotransposoner är mobila genetiska element som rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en kopia och klistra mekanism. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan DNA-transposoner och retrotransposoner. Dessutom tillhör DNA-transposoner klass II transposerbara element, medan retrotransposoner tillhör klass I transposerbara element.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan DNA-transposoner och retrotransposoner i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – DNA-transposoner vs retrotransposoner
DNA-transposoner och retrotransposoner är mobila genetiska element. DNA-transposoner flyttar sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en cut-paste-mekanism. Retrotransposoner rör sig från en plats till en annan i genomet genom att använda en kopierings- och klistramekanism. Så detta sammanfattar skillnaden mellan DNA-transposoner och retrotransposoner.
