Nyckelskillnaden mellan T4 DNA-ligas och E. coli DNA-ligas är att T4 DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från bakteriofag T4 medan E. coli DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från bakterien E. coli.
DNA-ligas är en specifik typ av enzym som underlättar sammanfogningen av DNA-strängar genom bildandet av en fosfodiesterbindning. Det spelar en viktig roll genom att reparera enkelsträngsbrott och dubbelsträngsbrott i levande organismers DNA. Dessutom används DNA-ligas i både DNA-reparation och DNA-replikation. Förutom ovanstående användningar har DNA-ligas också omfattande användning i molekylärbiologiska experiment såsom rekombinant DNA-teknologi. T4 DNA-ligas och E. coli DNA-ligas är två typer av DNA-ligasenzymer.
Vad är T4 DNA-ligas?
T4-ligas är ett DNA-bindande enzym som är isolerat från bakteriofag T4. T4 bakteriofag är ett virus som infekterar Escherichia coli. T4-ligasenzym är det vanligaste DNA-ligaset i molekylärbiologisk laboratorieforskning. Norm alt katalyserar T4-ligas sammanfogningen av två kohesiva eller trubbiga strängar av dubbelsträngat DNA mellan 5'-fosfat- och 3'-hydroxylgrupperna i intilliggande nukleotider. Det kan också katalysera sammanfogningen av RNA till antingen en DNA- eller RNA-sträng i en duplexmolekyl. Detta enzym kommer emellertid inte att förena enkelsträngade nukleinsyror. Dessutom kan den även ligera trubbigt DNA med mycket större effektivitet än E. coli DNA-ligas.
Figur 01: T4 DNA-ligas
Detta enzym kräver ATP som en kofaktor. Vissa gentekniska forskningsexperiment har redan producerat mer aktiva DNA-ligasenzymer än vildtyp T4 DNA-ligas. I ett av tillvägagångssätten skapade de en fusionsenzymmolekyl genom att kamma T4 DNA-ligas till antingen p50- eller NF-kB-molekyl. Detta nya T4-ligasenzym var 160 % mer aktivt i trubbiga-ändliga ligeringar för kloningsändamål än vildtyp T4-DNA-ligas. Dessutom är den optimala temperaturen för T4 DNA-ligas för att katalysera ligeringsreaktionen mer exakt 16 °C.
Vad är E Coli DNA Ligase?
E. coli DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från E. coli-bakterier. Genen som är ansvarig för att göra E. coli DNA-ligas är lig-genen. E. coli-DNA, ligas såväl som de flesta prokaryot-DNA-ligaser, använder energi som erhålls av NAD (nikotinamidadenindinukleotid) för att skapa fosfodiesterbindningen.
Figur 02: E. Coli DNA Ligase
E. coli DNA-ligas är ett ligeringsenzym som kan sammanfoga DNA-fragment genom att katalysera bildningen av fosfodiesterbindningar mellan dubbelsträngade DNA-fragment som innehåller 5' fosfattermini och 3' hydroxyltermini. Dessutom ligerar det inte trubbigt DNA förutom under speciella förhållanden som molekylär trängsel med polyetylenglykol. Det kan inte heller förena RNA till DNA effektivt. Dessutom kan aktiviteten av E. coli DNA-ligas förstärkas genom närvaron av DNA-polymeras 1 i rätt koncentration. Men när koncentrationen av DNA-polymeras 1-enzym är högre, har det negativa effekter på E. coli DNA-ligasaktivitet.
Vilka är likheterna mellan T4 DNA-ligas och E Coli DNA-ligas?
- T4 DNA-ligas och E-coli DNA-ligas är två typer av DNA-ligasenzymer.
- Båda är proteiner som består av aminosyror.
- Dessa enzymer katalyserar bildandet av en fosfodiesterbindning mellan intill varandra liggande 5'-fosfat och 3'-hydroxylterminaler i duplex-DNA.
- De har omfattande användningsområden i molekylärbiologiska experiment som rekombinant DNA-teknik.
Vad är skillnaden mellan T4 DNA-ligas och E Coli DNA-ligas?
T4 DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från bakteriofag T4 medan E. coli DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från E. coli-bakterier. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan T4 DNA-ligas och E. coli DNA-ligas. Dessutom är energikällan för T4 DNA-ligas ATP. Å andra sidan är energikällan för E. coli DNA-ligas NAD.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan T4 DNA-ligas och E coli DNA-ligas i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – T4 DNA Ligase vs E Coli DNA Ligase
T4 DNA-ligas och E. coli DNA-ligas är två enzymer som katalyserar bildandet av en fosfodiesterbindning mellan intill varandra liggande 5'-fosfat och 3'-hydroxylterminaler i duplex-DNA. T4-ligas är ett enzym som är isolerat från bakteriofag T4 medan E. coli DNA-ligas är ett enzym som är isolerat från E. coli-bakterier. Så detta är den viktigaste skillnaden mellan T4 DNA-ligas och E coli DNA-ligas.
