Nyckelskillnaden mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA är att cellfritt DNA är olika former av DNA som cirkulerar fritt i blodet medan cirkulerande tumör-DNA är det fragmenterade tumörhärledda DNA som cirkulerar i blodet.
Cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA är två typer av cirkulerande nukleinsyror. Cirkulerande nukleinsyror upptäcktes av Mandel och Metal 1948. Senare upptäckte man att mängden cirkulerande nukleinsyror hos sjuka patienter är signifikant hög. Denna upptäckt gjordes först i relation till lupuspatienter. Dessutom har cirkulerande nukleinsyror ett högre prognostiskt värde och kan användas som en biomarkör för att upptäcka olika sjukdomar.
Vad är cellfritt DNA?
Cellfritt DNA (Cf DNA) avser olika former av DNA som cirkulerande tumör-DNA, cellfritt mitokondrie-DNA och cellfritt foster-DNA, etc., som cirkulerar fritt i blodet. De förhöjda nivåerna av cellfritt DNA observeras vid avancerade sjukdomar som cancer, trauma, sepsis, hjärtinfarkt, diabetes, stroke, sicklecellssjukdom, etc. Förutom cancer och fostermedicin är cellfritt DNA en användbar biomarkör för en mängder av åkommor. Detta DNA kan också användas för att detektera avstötning av transplantattransplantat. De används också för att fastställa vanlig stress, prenatal könsurskiljning och vid faderskapstest.
Figur 01: Cellfritt DNA
Ett cellfritt DNA är vanligtvis en dubbelsträngad extracellulär DNA-molekyl. Den består av små fragment (50 till 200 bp) och större fragment (21 kb). Dessutom har det redan erkänts som en pålitlig biomarkör för diagnos av prostatacancer och bröstcancer. Cellfritt DNA cirkulerar huvudsakligen i blodomloppet som nukleosomer. Nukleosomer är kärnkomplex av histoner och DNA. Cf-DNA kan kvantifieras med hjälp av olika tekniker såsom PCR, massivt parallell sekvensering, ultraviolett spektrometri, PicoGreen-färgning och ELISA. Eftersom Cf DNA-detektion i blodomloppet är en snabb, enkel, icke-invasiv, repetitiv metod, kommer den i framtiden att vara en potentiell biomarkör för att diagnostisera många sjukdomar som autoimmuna reumatiska sjukdomar och tumörer.
Vad är cirkulerande tumör-DNA?
Cirkulerande tumör-DNA (Ct-DNA) är det fragmenterade tumörhärledda DNA som cirkulerar i blodet. Den har ett tumörursprung. Eftersom en cirkulerande tumör kan återspegla hela tumörgenomet, har den fått stor attraktion för sin potentiella användbarhet i kliniska uppställningar. Flytande biopsier, som tar blod, kan användas för att testa cirkulerande tumörer.
Figur 02: Cirkulerande tumör-DNA
De biologiska processer som sannolikt är involverade i frisättning av Ct-DNA inkluderar apoptos och nekros från döende celler eller aktiv frisättning från tumörceller. I friska vävnader kan infiltrerande fagocyter rensa Ct-DNA. Vidare kan olika tekniker användas för att analysera cirkulerande tumör-DNA, såsom droplet digital PCR, BEAMing, CAPP-Seq (djup sekvensering), säker sekvensering och duplex sekvensering.
Vilka är likheterna mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA?
- Cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA är två typer av cirkulerande nukleinsyror.
- De består av nukleotider.
- Båda typerna kan användas som potentiella markörer för att diagnostisera olika sjukdomar i kliniska inställningar.
- De finns i blodomloppet.
- Båda är extracellulära former av DNA-molekyler.
- De rensas båda upp av infiltrerande fagocyter.
Vad är skillnaden mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA?
Cellfritt DNA är olika former av DNA såsom cirkulerande tumör-DNA, cellfritt mitokondrie-DNA och cellfritt foster-DNA, etc., som cirkulerar fritt i blodet, medan cirkulerande tumör-DNA är det fragmenterade tumörhärledda DNA:t som cirkulerar i blodet. Så detta är nyckelskillnaden mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA. Vidare cirkulerar cellfritt DNA i fragment som sträcker sig från 50-220 bp medan cirkulerande tumör-DNA cirkulerar i fragment från 134-144 bp.
Följande infografik visar skillnaden mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Cellfritt DNA vs cirkulerande tumör-DNA
Cirkulerande nukleinsyror kastas in i blodomloppet genom reglerade eller slumpmässiga mekanismer. Cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA är två typer av cirkulerande nukleinsyror. Cellfritt DNA är olika former av DNA såsom cirkulerande tumör-DNA, cellfritt mitokondrie-DNA, cellfritt foster-DNA som fritt cirkulerar i blodet medan cirkulerande tumör-DNA är det fragmenterade tumörhärledda DNA:t som cirkulerar i blodet. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan cellfritt DNA och cirkulerande tumör-DNA.
