Nyckelskillnaden mellan sammansatta transposoner och IS-element är att sammansatta transposoner är en typ av transposoner som bär accessoriska gener som antibiotikaresistensgener, medan IS-element (eller Insertion Sequence-element) är transposerbara element som endast bär gener som kodtransposas som katalyserar transponeringsaktiviteten.
Ett transposon är ett fragment av DNA som kan ändra sin position i bakteriegenomet. Därför är de mobila DNA-sekvenser. De flyttar till nya platser i genomet, gör förändringar i sekvensen av bakteriegenomet, vilket orsakar betydande förändringar i genetisk information. Transposoner är också kända som hoppgener eftersom de kan blockera transkriptionen av gener och omorganisera bakteriens genetiska material. Dessutom är de ansvariga för rörelsen av läkemedelsresistens, antibiotikaresistensgener mellan plasmider och kromosomer. Sammansatta transposoner och IS-element är två typer av mobila genetiska element som finns i bakterier. Båda kan flytta från en plats till en annan i genomet.
Vad är sammansatta transposoner?
Ett sammansatt transposon är ett segment av DNA flankerat av två kopior av liknande insättningssekvenselement. Det finns en central proteinkodande region i sammansatt transposon. Generna är ofta antibiotikaresistenta gener. De kan också innehålla katabola gener. Dessutom består sammansatt transposon av två inverterade upprepningar. Hela längden av den sammansatta transposonen rör sig som en komplett enhet.
Figur 01: Composite Transposon
Tn10 är en sammansatt transposon. Den består av en 6,5 kb central kodande region (tetracyklinresistent gen) och 1,4 kb inverterade insättningssekvenselement i varje ände. IS-element levererar transposas. Transposas är ett enzym som katalyserar transposonets rörelse. Sammansatta transposoner kan amplifieras, designa primers för IS-element.
Vad är IS-element?
Infogningssekvenselement eller IS-element är en typ av mobila genetiska element. De är en enkel form av transposoner. De bär endast gener som kodar för transposasenzymer. Transposasenzymer katalyserar transpositionen av transposoner. Strukturellt flankeras den kodande sekvensen av IS-element av två inverterade upprepningar. Till exempel är IS-elementet IS911 flankerat av två 36bp inverterade upprepade extremiteter.
IS-element är de mest förekommande autonoma transponerbara elementen i bakteriegenomet. Därför är de extremt viktiga för prokaryota genomorganisation och evolution. Dessutom förekommer IS-element som delar av sammansatta transposoner. I allmänhet hittas två IS-element som flankerar den kodande sekvensen för den sammansatta transposonen. Men enhetstransposoner har inte flankerande IS-element.
Eftersom IS-element kan röra sig inom genomet kan de avbryta den kodande sekvensen för andra gener och inaktivera generna genom att blockera uttryck.
Vilka är likheterna mellan sammansatta transposoner och IS-element?
- Både sammansatta transposoner och IS-element kan ändra positionen i bakteriegenomet.
- Kodningsområdet i båda transposonerna flankeras vanligtvis av inverterade upprepningar.
- En sammansatt transposon flankeras av två separata IS-element.
Vad är skillnaden mellan sammansatta transposoner och IS-element?
Komposittransposoner är mobila genetiska element som består av två insättningssekvenser (IS) som ofta flankerar en eller flera antibiotikaresistensgener. Å andra sidan är IS-element en typ av enkelt transposerbart element som innehåller gener som kodar för transposasenzym för att katalysera transposition. Så detta är den viktigaste skillnaden mellan sammansatta transposoner och IS-element.
Nedan är en lista över skillnader mellan sammansatta transposoner och IS-element i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Composite Transposons vs IS Elements
Ett bakteriegenom har genetiska element som är rörliga. Sammansatta transposoner och IS-element är två typer av mobila genetiska element. Komposittransposoner bär antibiotikaresistenta gener och flankerande IS-element. IS-element bär den genetiska koden för att producera transposas som katalyserar förflyttningen av transposoner. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan sammansatta transposoner och IS-element.
