Nyckelskillnaden mellan DNA och proteinmikroarray är att DNA-mikroarray är en samling mikroskopiska DNA-fläckar fästa på en fast yta som ett objektglas, medan proteinmikroarray är ett arrangemang av renade proteiner på en fast yta som ett glas bild.
Microarray är en lab on a chip (LOC)-enhet. Det är en miniatyr, multiplex, parallell bearbetnings- och detektionsenhet. Det är också en tvådimensionell array på en fast yta som en glasskiva eller tunnfilmscell av silikon. En mikroarray analyserar en stor mängd biologiskt material med hjälp av screening med hög genomströmning. Den första mikromatrisen var antikroppschippet som introducerades av Tse Wen Chang 1983. Det första genchippet introducerades 1995 av Ron Davis och Pat Brown vid Stanford University. Därför är DNA- och proteinmikroarray två typer av mikroarrayenheter.
Vad är DNA Microarray?
DNA-mikroarray är en samling mikroskopiska DNA-fläckar fästa på en fast yta som ett objektglas. Forskare använder DNA-mikroarray för att mäta uttrycket av ett stort antal gener samtidigt. Det används också för att genotypa flera regioner i ett genom. DNA-mikroarrayen framställs med hjälp av robotmaskiner. Dessa maskiner arrangerar hundratals eller tusentals gensekvenser (sonder) på ett enda mikroskopiskt objektglas.
Figur 01: DNA Microarray
I en DNA-mikroarray innehåller varje DNA-fläck pikomoler (10−12 mol) av en specifik DNA-sekvens. Dessa DNA-sekvenser är också kända som prober eller reportrar. Dessa prober är ett kort DNA-segment av en gen eller annat DNA-element. De kan hybridisera med cDNA eller CRNA i ett prov under hög stringenta förhållanden. De fluorescensmärkta provsekvenserna som binder till prober genererar signaler som beror på hybridiseringsförhållanden såsom temperatur. Därför kan denna metod användas för att bestämma den relativa förekomsten av nukleinsyrasekvenser i provet. Dessutom används DNA-mikroarraytekniken i stor utsträckning i studier av genuttryck, jämförande genomstudier, kontroll av kontaminering av mat eller cellkulturer av patogener, utvärdering av genmutationer, identifiering av läkemedelskandidater, genetisk kopplingsanalys, etc.
Vad är Protein Microarray?
Protein-mikroarray är ett arrangemang av renade proteiner på en fast yta som ett objektglas. Det är en metod som används för att upptäcka interaktioner och aktiviteter hos proteiner. Det används också för att bestämma proteiners funktioner i stor skala. Den största fördelen med proteinmikroarray är att ett stort antal proteiner kan spåras parallellt. Protein microarray är ett chip som består av en stödyta som glasskiva, nitrocellulosamembran, pärla eller mikrotiterplatta. Infångningsproteinerna (antikroppar, antigener) är bundna till denna fasta yta. Sondmolekylerna som vanligtvis är märkta med ett fluorescerande färgämne läggs senare till arrayen. Hybridiseringen mellan prob och immobiliserade proteiner avger en fluorescerande signal som kan detekteras av en laserskanner.
Figur 02: Protein Microarray
Den första proteinmatrisen är en antikroppsmikroarray (antikroppsmatrix) som introducerades 1983. Proteinmikroarrayer är snabba, automatiserade, mycket känsliga och ekonomiska. De förbrukar också endast en liten mängd prover och reagens. Dessutom används proteinmikroarrayer i stor utsträckning för sjukdomsdiagnostik, proteinfunktionsanalys, antikroppskarakterisering och behandlingsutveckling.
Vilka är likheterna mellan DNA och proteinmikroarray?
- DNA och proteinmikroarray är två typer av mikroarrayenheter.
- Båda enheterna är baserade på hybridiseringsprincipen.
- Båda enheterna använder sonder.
- De använder också fluorescenssignaler för att detektera hybridisering.
- De är båda oerhört hjälpsamma vid sjukdomsdiagnostik inom medicin.
Vad är skillnaden mellan DNA och proteinmikroarray?
DNA-mikroarray är en samling mikroskopiska DNA-fläckar fästa på en fast yta som ett objektglas. Däremot är proteinmikroarray ett arrangemang av renade proteiner på en fast yta som en glasskiva. Så detta är nyckelskillnaden mellan DNA och proteinmikroarray. Dessutom, i en DNA-mikroarray är provet och sonden DNA-sekvenser. Å andra sidan, i proteinmikroarray är provet och sonden proteiner.
Följande infografik visar skillnaderna mellan DNA och proteinmikroarray i tabellform.
Sammanfattning – DNA vs Protein Microarray
En mikromatris är ett högkapacitets- och multiplexlabb-på-ett-chip. Den är gjord utifrån hybridiseringsprincipen. DNA och proteinmikroarray är två typer av mikroarrayenheter. DNA-mikroarray är en samling mikroskopiska DNA-fläckar fästa på en fast yta som ett objektglas. Å andra sidan är proteinmikroarray ett arrangemang av renade proteiner på en fast yta som en glasskiva. Detta är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan DNA och proteinmikroarray.
