nyckelskillnaden mellan RNA-interferens och antisens-oligonukleotid är att RNA-interferens är en teknik som involverar sekvensspecifikt undertryckande av genuttryck av ett dubbelsträngat RNA medan antisens-oligonukleotid är en teknik som involverar sekvensspecifik suppression av genuttryck av en enkelsträngad DNA-oligonukleotid.
Gentystnad eller suppression är ett sätt att reglera genuttryck i en biologisk cell för att förhindra uttryck av en specifik gen. Norm alt, när gener tystas, reduceras deras uttryck. När gener däremot slås ut raderas de helt från organismens genom; kommer alltså inte att ha något uttryck. Ibland anses gentystnad vara detsamma som gennedbrytning. Detta beror på att gentystnadsmetoder som RNAi, antisensoligonukleotid och CRISPR som används för att tysta gener orsakar en minskning av genuttrycket med minst 70 %. RNA-interferenser och antisens-oligonukleotider är två viktiga genljudningstekniker.
Vad är RNA-interferens?
RNA-interferens (RNAi) är en biologisk process där dubbelsträngade RNA-molekyler utför sekvensspecifik suppression av genuttryck. Andrew Fire och Craig C. Mello delade Nobelpriset 2006 i medicin för deras exceptionella arbete med RNA-interferens i nematodmask: Caenorhabditis elegans. Denna banbrytande forskning om RNA-interferens publicerades först av dem 1998. Vanligtvis finns RNAi-vägen i många eukaryota organismer, inklusive djur.
Figur 01: RNA-interferens
Två centrala molekyler, mikroRNA (miRNA) och små interferens-RNA (siRNA), är involverade i RNAi-vägen. Ett enzym som kallas Dicer inducerar denna väg. Dicer klyver långt dubbelsträngat RNA till korta dubbelsträngade fragment (21 nukleotider siRNA). Sedan lindas varje siRNA av till två enkelsträngade RNA kända som passagerarsträng och guidesträng. Passagerarsträngen bryts ned medan styrsträngen är inkorporerad i det RNA-inducerade tystande komplexet (RISC). I RISC parar guidesträngen med komplementärt mRNA, vilket utlöser Argonaute (Ago2), den katalytiska komponenten i RISC-komplexet. Senare klyver Argonaute mRNA-molekylen. Till skillnad från siRNA, riktar mikroRNA (miRNA) sig på den 3' oöversatta regionen av mRNA där de binder med ofullständig komplementaritet. Detta blockerar åtkomst av mRNA till ribosomer för translation.
Vad är antisensoligonukleotid?
Antisense-oligonukleotid är en teknik som involverar sekvensspecifikt undertryckande av genuttryck av en enkelsträngad DNA-oligonukleotid. Denna teknik kallas också antisense therapy Det är en form av terapi som använder antisense oligonukleotider (ASOs) för att rikta budbärar-RNA (mRNA). Antisens-oligonukleotider förändrar mRNA-uttrycket genom att använda en mängd olika mekanismer, såsom ribonukleas H-medierad sönderfall av pre-mRNA, direkt sterisk blockering och modulering av exoninnehåll genom splitsningsställesbindning på pre-mRNA.
Figur 02: Antisensoligonukleotid
Flera antisense-oligonukleotider har godkänts av USA och Europeiska unionen för sjukdomsbehandling. Dessutom har antisense-oligonukleotider redan godkänts som terapi för många sjukdomar, inklusive Battens sjukdom, cytomegalovirusretinit, Duchennes muskeldystrofi, familjärt kylomikronemisyndrom, familjär hyperkolesterolemi, ärftlig transtyretinmedierad amyloidos och spinal muskelatrofi.
Vilka är likheterna mellan RNA-interferens och antisensoligonukleotid?
- RNA-interferens och antisense-oligonukleotid är två viktiga genljudningstekniker.
- Båda teknikerna är inriktade på mRNA-molekyler.
- De är sekvensspecifika tekniker.
- Båda teknikerna används som terapier för många sjukdomar.
- Båda hämmar genuttryck.
Vad är skillnaden mellan RNA-interferens och antisensoligonukleotid?
RNA-interferens är en teknik som involverar sekvensspecifikt undertryckande av genuttryck av ett dubbelsträngat RNA medan antisensoligonukleotid är en teknik som involverar sekvensspecifikt undertryckande av genuttryck av en enkelsträngad DNA-oligonukleotid. Så detta är nyckelskillnaden mellan RNA-interferens och antisensoligonukleotid.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan RNA-interferens och antisensoligonukleotid i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – RNA-interferens vs antisensoligonukleotid
Gentystnadstekniker minskar cellulärt genuttryck. RNA-interferens och antisens-oligonukleotid är två viktiga genljudstekniker. RNA-interferens är en teknik som involverar sekvensspecifik undertryckning av genuttryck av ett dubbelsträngat RNA medan antisensoligonukleotid är en teknik som involverar sekvensspecifikt undertryckande av genuttryck av en enkelsträngad DNA-oligonukleotid. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan RNA-interferens och antisensoligonukleotid.
