Nyckelskillnaden mellan replikativ transponering och klipp och klistra transponering är att vid replikativ transponering kopieras transposonet till en ny plats, medan transposonet flyttas till en ny plats vid klipp och klistra transponering.
Transposerbara element eller hoppande gener är DNA-sekvenser som kan ändra sin position i genomet. Detta kallas införlivande. Transposition kan ibland skapa eller vända mutationer och förändra cellens genetiska identitet och genomstorlek. Transposition upptäcktes av Barbara McClintock 1983. Transposition kan ske genom två tekniker som duplicering och klipp och klistra.
Vad är replikativ transponering?
Replikativ transponering är en typ av transponeringsmekanism som hjälper till att avlägsna transposon från den ursprungliga platsen till en annan genom replikerad eller duplicerad teknik. Denna mekanism hittades först av James A Shapiro 1979. I denna mekanism dupliceras det transponerbara elementet under transponeringsreaktionen så att den transponerande enheten är en kopia av det ursprungliga elementet. I denna mekanism bildar dessutom donator- och receptor-DNA-sekvenserna en karakteristisk mellanliggande "theta"-konfiguration som kallas Shapiro-intermediär (samintegrerad). Replikativ transposition är en karakteristisk retrotransposon. Denna mekanism förekommer norm alt i klass I-transposoner.
Figur 01: Replikativ transponering
Ett bra exempel på replikativ transponering kan observeras i E. coli TN3-transposon. TN3-transposon kan flytta från den ursprungliga plasmiden till en annan målplasmid genom replikerad eller duplicerad teknik. Hela denna händelse förmedlas av två viktiga enzymer som kallas transposas och resolvas. Dessutom kan replikativ transposition observeras i både DNA-transposoner och retroposoner. Det bäst studerade transposerbara bakterieviruset är bakteriofagen Mu.
Vad är klipp och klistra omsättning?
Klipp och klistra transponering är en typ av transponeringsmekanism som hjälper till att avlägsna transposon från den ursprungliga platsen till en annan genom klipp- och klistratekniken. Denna mekanism är också känd som den konservativa modellen för införlivande. I denna icke-replikativa transponering sker excision och integrering av en transposon från en genomisk plats till en annan utan att lämna en kopia efter sig.
Figur 02: Klipp ut och klistra transposition
I denna mekanism binder transposasenzymet först till de terminala repetitioner som vanligtvis finns på båda ändarna av transposonerna och det bildar sedan en struktur som kallas synaptiskt komplex (transpososom). Det synaptiska komplexet klyver transposonet från dess ursprungliga genomiska läge och integrerar det i den nya målplatsen. Därefter lämnar transposaser från båda ändarna av transposonet. När transposasenzymet lämnar transposonet fylls luckorna av värdpolymerasenzymet. Detta möjliggör fullständig sammanfogning av transposonet till den nya genomiska platsen. Denna mekanism förekommer norm alt i klass II-transposoner. Dessutom är TN5 bakteriella transposoner ett välkänt exempel som visar en konservativ eller klipp och klistra transpositionsmekanism.
Vilka är likheterna mellan replikativ transponering och klipp och klistra?
- Replikativ transponering och klipp och klistra transponering är två typer av transponeringsmekanismer.
- I båda mekanismerna flyttar de transposerbara elementen från en genomisk plats till en annan ny genomisk plats.
- Båda mekanismerna kan skapa eller vända mutationer och förändra cellens genetiska identitet.
- Bakteriella transposoner visar båda mekanismerna.
- De är extremt viktiga händelser för evolutionen.
Vad är skillnaden mellan replikativ transponering och klipp och klistra?
Replikativ transponering är en typ av transponeringsmekanism där transposonet kopieras till en ny plats, medan klipp och klistra transponering är en typ av transponeringsmekanism där transposonet flyttas till en ny plats. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan replikativ transponering och klipp och klistra in. Dessutom sker replikativ transponering norm alt i klass I-transposoner, medan klipp- och klistratransponering norm alt sker i klass II-transposoner.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan replikativ transponering och klipp och klistra transponering i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Replikativ transponering vs klipp och klistra transponering
Replikativ transponering och klipp och klistra transponering är två typer av transponeringsmekanismer. Replikativ transposition är en typ av transponeringsmekanism där transposonet kopieras till en ny plats, medan klipp och klistra transposition är en typ av transpositionsmekanism där transposonet flyttas till en ny plats. Så detta sammanfattar skillnaden mellan replikativ transponering och klipp och klistra transponering.
