Nyckelskillnaden mellan gen knockout och knockdown är att gen knockout är en teknik där genen av intresse tas bort helt (inoperativt tillstånd) för att studera genens funktioner medan gen knockdown är en annan teknik där genen av intresset tystas för att undersöka den speciella genens roll i ett biologiskt system.
Olika genetiska tekniker är i drift för att undersöka hur gener fungerar i de levande biologiska systemen. Gen knockout och knockdown är två sådana tekniker. Dessa tekniker hjälper forskare att identifiera funktionella aspekter av olika gener i levande organismer.
Vad är Gene Knockout?
Gen knockout är en genetisk teknik som gör att en eller flera gener inte fungerar i levande organismer. Detta är också en process för att stänga av eller ta bort en gen från en organism. Den primära tillämpningen av denna teknik är att studera genens funktion. Processen utvärderar effekten av den förlorade eller borttagna genen. Knockout-processen involverar också vissa enzymer och skarvningstekniker.
Figur 01: Gene Knockout
Det finns få variationer i genknockouttekniken baserat på antalet involverade gener. De är dubbel knockout (knockout av två gener), trippel knockout (knockout av tre gener) och fyrfaldig knockout (knockout av fyra gener). Gen knockout klassificeras vidare i två grupper; heterozygot knockout och homozygot knockout.
Vad är Gene Knockdown?
Gen knockdown är en experimentell procedur där denna procedur undertrycker eller minskar uttrycket av en viss gen eller gener från en organism. Gentystnad är den vanliga definitionen för gen knockdown. Under denna procedur involverar aktiveringen eller nedbrytningen av det producerade mRNA:t RNA-interferens (RNAi), litet interfererande RNA (siRNA) och kort hårnåls-RNA (shRNA).
Figur 02: Gentystnad
Den primära användningen av gen knockdown är att undersöka vilken roll den specifika genen har i det biologiska systemet. Därför åstadkommer denna teknik studiet av onkogener (Bcl-2 och P53) och gener som orsakar neurologiska sjukdomar, virusinfektioner och ärftliga sjukdomar.
Vilka är likheterna mellan Gene Knockout och Knockdown?
- Både gen knockout och gen knockdown är genetiska tekniker.
- Dessa två tekniker kan förhindra genuttryck.
- Den primära användningen av båda teknikerna är att undersöka funktionen hos genen av intresse.
- Båda kan identifiera olika sjukdomstillstånd (genetiska).
- De båda skulle kunna användas för en eller flera gener av intresse.
Vad är skillnaden mellan Gene Knockout och Knockdown?
Gene Knockout vs Knockdown |
|
| Gen knockout är in-operation av gener (borttagning av gener från DNA) från en organism genom olika genetiska tekniker. | Gen knockdown är en experimentell procedur för att undertrycka (minska eller tysta) uttrycket av en viss gen eller gener i en organism. |
| Function | |
| Lättar studiet av geners funktioner genom att analysera resultaten av den förlorade genen. | Underlättar studiet av onkogener, gener som orsakar neurologiska sjukdomar, virusinfektioner och ärftliga sjukdomar. |
| Medverkan av RNA-agenter | |
| Inblandning av RNA-agens är obetydlig i denna teknik. | Processen involverar medel som siRNA, shRNA och RNAi för att inaktivera mRNA:t. |
| Användning av kemiska medel | |
| Enzymatiska medel används. | Inga sådana kemiska medel används. |
| Effekt på gen | |
| Tar bort genen från DNA:t. | Undertryck eller tysta genen. |
| Klassificering | |
| Dubbel knockout, trippel knockout och fyrfaldig knockout och heterozygot och homozygot knockout är olika typer av gen knockout. | Inga sådana klassificeringssystem tillgängliga för gentystnad. |
Sammanfattning – Gene Knockout vs Gene Knockdown
De två teknikerna vi diskuterade här; gen knockout och knockdown, är metoder för att undersöka olika geners funktioner. Gen knockout gör genen helt inoperativ medan gen knockdown tystar genen av intresse. Båda procedurerna förhindrar dock genuttrycket. Olika medel är kapabla att utföra dessa två processer. Gen knock out är en typ av deletion medan gen knockdown är en typ av inaktivering. Det här är skillnaden mellan gen-knock-out och knockdown.
