Nyckelskillnaden mellan genkartläggning och gensekvensering är att genkartläggning är en teknik som identifierar platsen för en gen i genomet och avstånden mellan gener, medan gensekvensering är en teknik som identifierar den exakta ordningen av nukleotider av en gen.
Genkartläggning och gensekvensering är viktiga i genetisk diagnostik för att lokalisera och bekräfta förekomsten av gener. Således spelar molekylära tekniker såsom gelelektrofores och polymeraskedjereaktion viktiga roller för att härleda en genkarta. Dessutom är användningen av olika sekvenseringstekniker såsom Sanger-sekvensering och nästa generations sekvensering avgörande för att generera en gensekvens.
Vad är genkartläggning?
Genkartläggning är tekniken för att generera en komplett karta över var generna finns i en kromosom. Kromosomkartläggning är en synonym för genkartläggning. Vidare ger denna teknik information om de specifika generna som finns i kromosomen. Dessutom använder genkartläggning fysiska kartläggningsmetoder under kartläggningsprocessen.
Figur 01: Genkartläggning
Genkartläggning kan hjälpa till att hitta kromosomavvikelser. Därför fungerar den genetiska kartan som ett diagnostiskt verktyg för att upptäcka tillstånd som Downs syndrom och Turners syndrom, etc. Karyotypning är en teknik som kan användas för att generera en genetisk karta. Färgning är en viktig teknik för att skapa en genetisk karta där färger som etidiumbromid, akridin orange och Giemsa används. Genkartläggning kan också generera länkkartor där identifiering av platsen för de länkade generna äger rum.
Vad är gensekvensering?
Gensekvensering är den teknik som används för att identifiera och härleda genens exakta basparsekvens. Genom gensekvensering kan man alltså härleda ordningen av adenin-, guanin-, tymin- och cytosinbaser i en sekvens. Den första helgenomsekvenseringen ägde rum i mikroorganismer. Det mänskliga genomets sekvenseringsprojekt var en av vändpunkterna i molekylärbiologins historia. För närvarande spelar gensekvensering en viktig roll inom industri och medicinska områden. Detta bekräftar exakt närvaron av en viss gen i genomet.
Figur 02: Gensekvensering
Det finns olika tekniker för att sekvensera en gen. Maxam och Gilbert var pionjärerna med att introducera en kemisk metod för att sekvensera gener eller DNA. Användningen av potentiellt farliga kemikalier leder dock till att den kemiska sekvenseringstekniken överges. Senare introducerade Sanger en sekvenseringsteknik som inte använde några farliga kemikalier. Men för närvarande spelar automatiserad sekvensering och nästa generations sekvensering viktiga roller för att härleda sekvensen för en viss gen.
Vilka är likheterna mellan genkartläggning och gensekvensering?
- Båda teknikerna spelar viktiga roller i genetisk diagnostik.
- Dessa tekniker har förmågan att bekräfta närvaron av gener i genomet.
- Tekniker som polymeraskedjereaktion kan användas i båda processerna.
Vad är skillnaden mellan genkartläggning och gensekvensering?
Nyckelskillnaden mellan genkartläggning och gensekvensering är informationen som de två teknikerna genererar. Genkartläggning ger information om platsen för en viss gen i en kromosom medan gensekvensering genererar information om sekvensen av baspar av en viss gen. Båda teknikerna spelar dock en roll i karakteriseringen av en gen. Således skiljer sig tiden och kostnaden för att slutföra de två teknikerna.
Infografiken nedan sammanfattar skillnaden mellan genkartläggning och gensekvensering.
Sammanfattning – Genmapping vs Gen Sequencing
Genkartläggning och gensekvensering är två tekniker som hjälper till att karakterisera en gen. Medan en genkarta gör det möjligt att lokalisera genen, tillhandahåller gensekvensen biokemiska data för just den genen. Genkartläggning och gensekvensering är mycket viktiga i genetiska studier och genetisk diagnostik. Dessutom är båda teknikerna nu automatiserade för att säkerställa att teknikerna är snabba och exakta. Informationen som genereras genom genkartläggning och gensekvensering används i nedströmsprocesser under molekylär diagnostik.
