Nyckelskillnaden mellan konserverad sekvens och konsensussekvens är att konserverad sekvens hänvisar till liknande sekvenser av nukleinsyror eller aminosyror som förekommer i olika eller samma arter under generationer medan konsensussekvens är en vanligt förekommande nukleotidsekvens eller aminosyrasekvens som hittas i en mycket konserverad region av DNA eller RNA eller protein.
Organismer delar liknande och olika egenskaper. När man studerar relationerna mellan organismer och klassificerar dem är genomet eller genetisk sammansättning av organismer mycket viktigt. Det finns några nukleotid- eller aminosyrasekvenser som är vanliga bland olika organismer. En konserverad sekvens är en nukleinsyra- eller aminosyrasekvens som är konsekvent mellan arter. Därför är de fylogenetiskt viktiga när de genererar fylogenetiska träd. I konserverade sekvenser finns det specifika nukleotidsekvenser som är vanligare. De är kända som konsensussekvenser.
Vad är bevarad sekvens?
En konserverad sekvens är en nukleinsyrasekvens eller aminosyrasekvens som är liknande bland arter. Därför är det konsekvent över arterna under hela evolutionen. I allmänhet upprätthålls dessa sekvenser genom naturligt urval. De förblir oförändrade långt bak i det fylogenetiska trädet. Därför är konserverade sekvenser viktiga för att konstruera fylogenetiska träd. Man tror att mycket konserverade sekvenser ofta har ett viktigt funktionellt värde. De är också användbara för att identifiera genetiska sjukdomar. Konserverade sekvenser kan emellertid vara kodande eller icke-kodande nukleinsyrasekvenser. Dessutom visar konserverade sekvenser långsammare mutationshastigheter. Därför visar de mycket minimala förändringar i sin sammansättning; ibland visar de inte förändringar över generationerna.
Figur 01: Bevarad sekvens
RNA-komponenter i ribosomer finns i livets alla domäner, homeobox-sekvenserna i eukaryoter och tmRNA i bakterier är flera exempel på mycket konserverade sekvenser. Identifiering av konserverade sekvenser är lätt när bioinformatiska tillvägagångssätt, särskilt sekvensanpassningsverktyget, används. Dessutom underlättar multipelsekvensanpassning visualiseringen av konserverade sekvenser.
Vad är konsensussekvens?
En konsensussekvens är en sekvens som vanligtvis finns i en given konserverad region av DNA eller RNA. Det är en mycket specifik nukleotidsekvens. Som ett exempel finns det en konsensussekvens vid -10 som TATAAT (Pribnow-box) i E. coli-promotorer, som är mycket konserverade sekvenser. På liknande sätt finns det en annan konsensussekvens: TTGACA i E. coli-promotorer vid -35 också. Konsensussekvenser är också kända som "boxar".
Figur 02: Konsensussekvens
Förutom DNA och RNA har proteiner även konsensussekvenser av aminosyror. Proteinbindningsställen representeras ofta av konsensussekvenser. Restriktionsenzymer har också konsensussekvenser. Dessutom är splitsningsställen också konsensussekvenser. I likhet med konserverade sekvenser kan konsensussekvenser beräknas och visualiseras med hjälp av bioinformatikverktyg.
Vilka är likheterna mellan bevarad och konsensussekvens?
- Konserverade sekvenser och konsensussekvenser är nukleinsyra- eller aminosyrasekvenser som är vanliga mellan arter.
- Både konserverade sekvenser och konsensussekvenser kan visualiseras med hjälp av bioinformatikverktyg.
- De används ofta inom molekylärbiologi.
Vad är skillnaden mellan bevarad och konsensussekvens?
Den konserverade sekvensen är en nukleinsyra- eller aminosyrasekvens som är konsekvent mellan arter medan konsensussekvenser är mycket specifika och vanligt förekommande baser eller aminosyror i en given konserverad region. Så detta är nyckelskillnaden mellan konserverad och konsensussekvens. En annan skillnad mellan konserverad och konsensussekvens är dessutom att de konserverade sekvenserna är fylogenetiskt viktiga medan konsensussekvenser ofta är proteinbindningsställen, splitsningsställen, restriktionsenzymskärningsställen, etc.
Sammanfattning – Konserverad vs konsensussekvens
Konserverade sekvenser är sekvenser av nukleinsyror eller proteiner som liknar levande arter. En promotor, ribosombindningsställe, ett replikationsursprung och aminosyrasekvens för histonprotein är flera exempel på konserverade sekvenser. Däremot är konsensussekvenser specifika baser eller aminosyror som är vanligare i en given konserverad sekvens. -10 rutor, -35 rutor med E. coli-promotor, proteinbindningsställen, splitsningsställen och restriktionsenzymer som känner igen ställen är flera exempel på konsensussekvenser. Detta är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan konserverad och konsensussekvens.
