Nyckelskillnaden mellan CDS och cDNA är att CDS eller kodande sekvens är den del av ett transkript som faktiskt översätts till protein medan cDNA-sekvensen är en DNA-sekvens som härrör från mRNA:t genom omvänd transkription.
En gen är en nukleotidsekvens som kodar för ett protein. Den består av olika regioner som promotorregion, transkriptionsinitieringsställe, exoner, startkodon, introner och stoppkodon. Därför har en gen både kodande och icke-kodande sekvenser. Kodande sekvenser eller CDS hänvisar till exonerna och två kodoner, som är startkodon och stoppkodon. Det är sekvensen som faktiskt översätts till ett protein. Däremot är cDNA en DNA-sekvens som härrör från mRNA:t genom omvänd transkription.
Vad är CDS?
CDS eller kodande sekvens är en del av en gen som faktiskt översätts till ett protein. Den består av exoner och två kodon som AUG-kodon och stoppkodon. Till skillnad från cDNA innehåller CDS inte två oöversatta regioner: 5' UTR och 3' UTR. Dessutom ingår inte introner i CDS.
Figur 01: Kodningssekvens
Jämfört med hela genomet och en individ är kodande sekvenser en liten del. Kodningssekvensen består av den nödvändiga nukleotidsekvensen för att göra proteinets aminosyrasekvens.
Vad är cDNA?
cDNA eller komplementärt DNA är en DNA-sekvens som genereras från mRNA-sekvens. Det syntetiseras av den process som kallas omvänd transkription. Enzymet omvänt transkriptas katalyserar cDNA-syntes och mRNA-sekvensen fungerar som mall för cDNA-syntes. I grund och botten kan mRNA från eukaryota celler extraheras och renas för att göra cDNA. Efter att ha konstruerat cDNA från mRNA kan de sedan klonas in i en bakteriecell för att skapa cDNA-bibliotek. cDNA-bibliotek är viktiga för analys av kodande regioner, genfunktioner och uttryck av gener, etc.
Figur 02: cDNA
Till skillnad från kodande sekvens, innehåller cDNA två UTR, som är 3' UTR och 5' UTR. I likhet med den kodande sekvensen innehåller cDNA inte introner.
Vilka är likheterna mellan CDS och cDNA?
- CDS och cDNA är nukleinsyror.
- De är gjorda av deoxiribonukleotider.
- Både CDS och CDNA innehåller inte introner, som är icke-kodande regioner.
- Båda innehåller den genetiska koden eller informationen för att producera ett protein.
Vad är skillnaden mellan CDS och cDNA?
CDS eller kodande sekvens är den del av en gen som faktiskt översätts till ett protein. Å andra sidan är cDNA-sekvensen en DNA-sekvens som härrör från mRNA:t genom omvänd transkription. Så detta är nyckelskillnaden mellan CDS och cDNA. Dessutom består CDS av exoner och två kodon, som är startkodon och stoppkodon. Däremot består cDNA av den fullständiga mRNA-sekvensen och två UTR.
Dessutom görs cDNA-syntes artificiellt från mRNA genom omvänd transkription medan CDS finns i det genomiska DNA:t.
Infografiken nedan visar fler jämförelser för att urskilja skillnaden mellan CDS och cDNA.
Sammanfattning – CDS vs cDNA
Kodande sekvens och cDNA är två typer av nukleotidsekvenser. Kodningssekvensen ligger inom en gen medan cDNA syntetiseras artificiellt. Kodningssekvensen har exoner och två kodoner medan cDNA har en mRNA-sekvens och två UTR. Både CDS och cDNA har bara de nukleotidsekvenser som faktiskt översätts till ett protein. De innehåller inga introner. Till skillnad från CDS kräver cDNA-syntesprocessen omvänt transkriptasenzym. Dessutom kan cDNA omvandlas till cDNA-bibliotek. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan CDS och cDNA.
