Nyckelskillnaden mellan serin och tyrosinrekombinas är att i serinrekombinas är serin den nukleofila aminosyran som används av enzymet för att attackera DNA under platsspecifik rekombination, medan i tyrosinrekombinas är tyrosin den nukleofila aminosyran som används av enzymet för att attackera DNA:t under platsspecifik rekombination.
Satsspecifik rekombination (konservativ platsspecifik rekombination) är en typ av genetisk rekombinationsteknik där utbyte av DNA-strängar sker mellan segment som har en viss grad av sekvenshomologi. Platsspecifika rekombinaser reglerar den platsspecifika rekombinationsprocessen. Dessa enzymer är grupperade i två familjer som serinrekombinasfamiljen och tyrosinrekombinasfamiljen. Namnen kommer från den konserverade nukleofila aminosyraresten som finns i ovanstående två klasser av rekombinaser som används för att attackera DNA och som blir kovalent kopplad till det under strängbyte i platsspecifik rekombination.
Vad är Serine Recombinase?
I den platsspecifika rekombinationsmetoden skärs två korta DNA-sekvenser ('målplatser') vid specifika punkter i båda strängarna och de skurna ändarna sammanfogas med nya partners. Platsspecifika rekombinationsteknologier är genomiska verktyg inom genteknik som är beroende av rekombinasenzymer för att ersätta målsektionen av DNA:t. Många platsspecifika rekombinationssystem har visat sig utföra dessa DNA-omarrangemang för olika ändamål. Men alla dessa rekombinasenzymer tillhör två familjer. Serinrekombinas är en av dem. De kan förmedla upp till tre typer av DNA-omarrangemang: integration, excision och inversion.
Figur 01: Serine Recombinase
De platsspecifika rekombinaserna som serinrekombinas utför DNA-omarrangemang genom att känna igen och binda till en kort DNA-sekvens (målställe), där de klyver DNA-ryggraden. Senare sker utbytet av två DNA-helixar och återförening av DNA-strängar äger rum. I serinrekombinas är serin den aminosyra som används av enzymet för att attackera DNA:t under platsspecifik rekombination. Under DNA-klyvning bildas protein-DNA-bindningen via en transesterifieringsreaktion. Fosfodiesterbindningen ersätts av fosfoserinbindningen mellan 5'fosfatgruppen vid klyvningsstället och hydroxylgruppen i en konserverad serinrest. Den nya bindningen lagrar energi som går åt till att klyva DNA på målplatsen. Denna energi används senare för att återförena DNA:t till motsvarande deoxiribos-hydroxylgrupp på det andra stället. Exempel på serinrekombinaser är serinresolvaser/invertaser och serinintegraser.
Vad är Tyrosine Recombinase?
Tyrosinrekombinas är den andra enzymklassen som reglerar konservativ platsspecifik rekombination. Som beskrivits tidigare utför tyrosinrekombinas också DNA-omarrangemang på samma sätt genom att känna igen och binda till en kort DNA-sekvens (målställe), vid vilken de klyver DNA-ryggraden. Senare sker utbyte av två DNA-helixar och åter sammanfogning av DNA-strängar.
Figur 02: Tyrosine Recombinase
Men i tyrosinrekombinas är tyrosin den aminosyra som används av enzymet för att attackera DNA:t under platsspecifik rekombination. Det gemensamma kännetecknet för denna klass är en konserverad nukleofil tyrosinrest som angriper det sprickbara DNA-fosfatet för att bilda en 3'-fosfotyrosinbindning. Tyrosinrekombinaser (A1) och tyrosinintegraser (A2) är de framträdande enzymgrupperna i tyrosinrekombinasenzymfamiljen.
Vilka är likheterna mellan serin och tyrosinrekombinas?
- De är en klass av rekombinasenzymer.
- Båda reglerar platsspecifik rekombination.
- De är proteiner.
- Den grundläggande kemiska reaktionen är densamma för båda.
- Båda katalyserar transesterifieringsreaktioner.
Vad är skillnaden mellan serin och tyrosinrekombinas?
I serinrekombinas är serin den nukleofila aminosyran som används av enzymet för att attackera DNA:t under platsspecifik rekombination. Å andra sidan, i tyrosinrekombinas, är tyrosin den nukleofila aminosyran som används av enzymet för att attackera DNA:t under platsspecifik rekombination. Så detta är nyckelskillnaden mellan serin och tyrosinrekombinas. Det gemensamma för serinrekombinas är att det bildar en fosfoserinbindning med DNA, medan tyrosinrekombinas bildar en fosfotyrosinbindning med DNA under den platsspecifika rekombinationsprocessen.
Infografiken nedan listar skillnaderna mellan serin och tyrosinrekombinas i tabellform.
-
Skillnaden mellan serin och tyrosinrekombinas i tabellform
Sammanfattning – Serine vs Tyrosine Recombinase
Rekombination kan förekomma mellan liknande DNA-molekyler som i homologrekombination eller olika molekyler som i icke-homologrekombination. Platsspecifik rekombination är en typ av genetisk rekombination där utbyte av DNA-strängar sker mellan segment som har åtminstone en viss grad av sekvenshomologi. Det katalyseras av rekombinaser. De flesta rekombinaser är grupperade i två familjer: serinrekombinas och tyrosinrekombinas. Serinrekombinas använder serin som den nukleofila aminosyran för att attackera DNA:t under den platsspecifika rekombinationsprocessen. Tyrosinrekombinas använder tyrosin som den nukleofila aminosyran för att attackera DNA:t under den platsspecifika rekombinationsprocessen. Därför är detta den viktigaste skillnaden mellan serin och tyrosinrekombinas.
