Nyckelskillnaden mellan restriktionsendonukleas och exonukleas är att restriktionsendonukleas är ett nukleasenzym som känner igen en specifik DNA-sekvens och klyver DNA:t inom eller intill den sekvensen, medan exonukleas är ett nukleasenzym som klyver nukleotiderna i en polynukleotid från antingen 5'-änden eller 3'-änden en i taget.
Nukleaser är de enzymer som klyver fosfodiesterbindningar mellan nukleotider av nukleinsyror. I levande organismer är de viktiga verktyg för många aspekter av DNA-reparation i cellen. Defekter av dessa enzymer kan orsaka genetisk instabilitet och immunbrist. Restriktionsnukleaserna är specifika nukleaser vars funktion är beroende av en specifik nukleotidsekvens. Ett exempel är restriktionsendonukleas. Det finns en grundläggande klassificering för nukleaser baserad på aktivitetsplatsen, såsom endonukleas och exonukleas. Endonukleas smälter regioner i mitten av mål-DNA-molekylen. Exonukleas smälter nukleinsyror från ändarna. Därför är restriktionsendonukleas och exonukleas två typer av nukleasenzymer.
Vad är restriktionsendonukleas?
Restriktionsendonukleas är ett nukleasenzym som känner igen en specifik DNA-sekvens och klyver DNA:t inom eller intill den sekvensen. Den specifika DNA-sekvensen är känd som restriktionsstället. Det kallas också ett restriktionsenzym eller restriktas. Restriktionsendonukleaset är ett mycket specifikt enzym. Det är en klass av den bredare endonukleasgruppen av enzymer. Restriktionsendonukleaser klassificeras vanligtvis i fem typer, som skiljer sig åt i sin struktur och förmåga att skära DNA-substratet vid igenkänningsstället. De fem typerna är typ I, typ II, typ III, typ IV och typ V.
Figur 01: Restriktionsendonukleas
Restriktionsendonukleaser finns vanligtvis i bakterier och archaea. De tillhandahåller en försvarsmekanism för bakterier mot virus. Det finns mer än 3600 kända restriktionsendonukleaser. De representerar över 250 olika särdrag. Över 3000 av dessa har studerats i detalj. Dessutom finns mer än 800 av dessa kommersiellt tillgängliga.
Vad är exonukleas?
Exonukleas är ett nukleasenzym som klyver nukleotiderna i en polynukleotid från antingen 5'-änden eller 3'-änden en i taget. Detta sker genom en hydrolyseringsreaktion som bryter fosfodiesterbindningar mellan nukleotiderna i slutet. Eukaryoter och prokaryoter har tre typer av exonukleaser. Dessa exonukleaser är involverade i den normala omsättningen av mRNA. De är 5' till 3' exonukleas (Xrn1), 3' till 5' exonukleas och poly-A-specifikt 3' till 5' exonukleas. 5' till 3' exonukleas är ett beroende avkapslande protein. 3' till 5' exonukleas är ett oberoende protein. Poly A-specifikt 3' till 5' exonukleas är också känt som poly-A-specifikt ribonukleas involverat i exonukleolytisk nedbrytning av poly-A-svans.
Figur 02: Exonukleas
I både archaea och eukaryoter utförs RNA-nedbrytning av multiproteinexosomkomplexet som består av 3' till 5' exoribonukleaser.
Vilka är likheterna mellan restriktionsendonukleas och exonukleas?
- Restriktionsendonukleas och exonukleas är två typer av nukleasenzymer.
- Båda enzymerna skär DNA-molekyler.
- Dessa enzymer finns i prokaryoter.
- De är proteiner.
Vad är skillnaden mellan restriktionsendonukleas och exonukleas?
Restriktionsendonukleas är ett nukleasenzym som känner igen en specifik DNA-sekvens och klyver DNA:t inom eller intill den sekvensen, medan exonukleas är ett nukleasenzym som klyver nukleotiderna i en polynukleotid från antingen 5'-änden eller 3'-änden en i taget. Så detta är nyckelskillnaden mellan restriktionsendonukleas och exonukleas. Dessutom finns restriktionsendonukleas bara i prokaryoter, medan exonukleas finns i både prokaryoter och eukaryoter.
Följande infografik listar skillnaderna mellan restriktionsendonukleas och exonukleas i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Begränsning av endonukleas vs exonukleas
Nukleaser är de enzymer som bryter fosfodiesterbindningar mellan nukleotider av nukleinsyror. Restriktionsendonukleas och exonukleas är två typer av nukleasenzymer. Restriktionsendonukleas är ett nukleasenzym som känner igen en specifik DNA-sekvens och klyver DNA:t inom eller intill den sekvensen. Exonukleas är ett nukleasenzym som klyver nukleotiderna i en polynukleotid från antingen deras 5'-ände eller 3'-ände en i taget. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan restriktionsendonukleas och exonukleas.
