Den viktigaste skillnaden mellan EcoRI och HindIII restriktionsenzymer är att EcoRI är ett typ II restriktionsenzym som är isolerat från E. coli, medan HindIII är ett typ II restriktionsenzym som är isolerat från Haemophilus influenza.
Restriktionsenzym eller restriktionsendonukleas är ett enzym som klyver DNA till fragment vid specifika igenkänningsställen (restriktionsställen) i DNA-molekylen. Dessa restriktionsenzymer finns i bakterier och arkéer. De tillhandahåller en försvarsmekanism mot invaderande virus. Restriktionsenzymer klassificeras generellt i fem olika typer: typ I, typ II, typ III, IV och typ V. EcoRI och HindIII är två restriktionsenzymer som tillhör gruppen av typ II restriktionsenzymer.
Vad är EcoRI-restriktionsenzymer?
EcoRI är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från E.coli-arter. Det är ett restriktionsenzym som klyver DNA-dubbla helixar till fragment på specifika platser. EcoRI är också en del av restriktionsmodifieringssystemet. EcoRI var det första enzymet som ursprungligen isolerades från RY13-stammen av E. coli-arten. Det används som ett restriktionsenzym inom molekylärbiologi. EcoRI skapar 4 klibbiga nukleotidändar med 5'-ändsöverhäng av AATT. EcoRI skär DNA vid den specifika igenkänningssekvensen G↓AATTC. Den har den palindromiska komplementära sekvensen av CTTAA↓G. Dessutom tillhör detta restriktionsenzym underklassen typ II P (palindromisk specificitet). I sin primära struktur innehåller EcoRI PD. D/EXK-motivet inom sin aktiva plats, liksom många andra restriktionsenzymer.
Figur 01: EcoRI
EcoRI-restriktionsenzym är en homodimer på 31 kDa. Den innehåller en globulär domän av α/β-arkitekturen. Varje subenhet innehåller en slinga som sticker ut från den globulära domänen och lindar sig runt DNA:t när det binds. Detta enzym kan samkristalliseras med den sekvens som det norm alt skär. Dessutom används restriktionsenzymet EcoRI i en mängd olika molekylärgenetiska tekniker, inklusive kloning, DNA-screening och deletionssektioner av DNA in vitro-tillstånd.
Vad är HindIII-restriktionsenzymer?
HindIII är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från Haemophilus influenza-arter. Den klyver DNA-palindromsekvensen AACCTT i närvaro av kofaktorn Mg2+ genom hydrolys. Klyvningen av denna speciella sekvens mellan AA'S (5'A↓ACCTT3' och 3'TTCGA↓A5') resulterar i 5' överhäng på DNA-molekylen som kallas klibbiga ändar. Detta enzym finns i prokaryota organismer som bakterier. Bakterier använder detta enzym som en försvarsmekanism mot virus som bakteriofager.
Figur 02: HindIII
Strukturmässigt är HindIII en homodimer. Den innehåller en gemensam strukturell kärna som består av fyra β-ark och en enda a-helix, liksom andra typer av II-restriktionsenzymer. Molekylmassan för detta enzym är 34,9 kDa. Dessutom är HindIII mycket användbar i moderna molekylärbiologiska vetenskapsexperiment som DNA-sekvensering och kartläggning.
Vilka är likheterna mellan EcoRI- och HindIII-restriktionsenzymer?
- EcoRI och HindIII är två restriktionsenzymer som tillhör typ II-restriktionsenzymgruppen.
- EcoRI och HindIII hittades i början av 1970-talet.
- EcoRI och HindIII innehåller båda PD.. D/EXK-aminosyrasekvensmotivet.
- Båda restriktionsenzymerna utför mycket specifik klyvning av DNA:t.
- Dessa restriktionsenzymer behöver Mg2+ som en kofaktor för sin specifika aktivitet.
- De producerar klibbiga ändar efter att ha klippt DNA.
- De är mycket användbara komponenter i modern molekylärbiologisk forskning.
Vad är skillnaden mellan EcoRI- och HindIII-restriktionsenzymer?
EcoRI är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från E.coli-arter, medan HindIII är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från Haemophilus influenza-arter. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan EcoRI och HindIII. Dessutom skär EcoRI DNA:t vid den specifika igenkänningssekvensen G↓AATTC, medan HindIII skär DNA:t vid den specifika igenkänningssekvensen A↓ACCTT.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan EcoRI och HindIII i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – EcoRI vs HindIII Restriction Enzymes
EcoRI och HindIII är två restriktionsenzymer som tillhör typ II p-subklassen. De utför mycket specifik klyvning av DNA:t. EcoRI är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från E.coli-arter, medan HindIII är ett typ II-restriktionsenzym som är isolerat från Haemophilus influenza-arter. Så detta sammanfattar skillnaden mellan EcoRI och HindIII.
