Nyckelskillnaden mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid är att guanidintiocyanat är en starkare proteindenatureringsmedel som är vanligare vid RNA-isolering, medan guanidinhydroklorid är en svagare proteindenatureringsmedel som används mindre vanligt vid RNA-isolering.
Denaturering är den process där proteiner förlorar sin kvartära struktur, tertiära struktur och sekundära struktur som norm alt är närvarande i sitt ursprungliga tillstånd. Det kan göras genom applicering av extern stress eller föreningar såsom en stark syra eller bas, ett koncentrerat oorganiskt s alt, ett organiskt lösningsmedel (alkohol, kloroform), omrörning, strålning eller värme. Guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid är två olika typer av proteindenatureringsmedel.
Vad är guanidintiocyanat?
Guanidintiocyanat (GTC) är ett starkare proteindenaturerande medel som är vanligare vid RNA-isolering. Det är också känt som guanidinium isotiocyanat (GITC). Eftersom det är ett kaotropiskt medel, är det en kemisk förening som rutinmässigt används som ett allmänt proteindenatureringsmedel. Ett kaotropiskt medel är en molekyl i en vattenlösning som kan störa vätebindningsnätverket mellan vattenmolekyler. Detta har en effekt på stabiliteten av det naturliga tillståndet för andra molekyler i lösningen, såsom makromolekyler som proteiner och nukleinsyror genom att försvaga den hydrofoba effekten. Kaotropa medel som guanidintiocyanat minskar mängden ordning i strukturen av protein som bildas av vattenmolekyler både i bulk och hydratiseringsskal runt hydrofoba aminosyror. Detta kan orsaka proteindenaturering.
Guanidintiocyanat kan användas för att inaktivera virus som influensa som orsakade sjukdomar som spanska sjukan 1918. Därför kan den användas i medicinska eller sjukhusuppställningar. Dessutom används guanidintiocyanat också för att lysera celler och viruspartiklar i RNA- och DNA-extraktioner. Här är funktionen av guanidintiocyanat att underlätta lyserande verkan och att förhindra aktiviteten av RNas-enzymer och DNas-enzymer genom denaturering. Dessa enzymer skulle annars skada extraktet (RNA eller DNA).
Vad är guanidinhydroklorid?
Guanidinhydroklorid (GdnHCl) är en svagare proteindenatureringsmedel som används mindre vanligt vid RNA-isolering. Det är också känt som guanidiniumklorid (GdmCl). Det är hydroklorids altet av guanidin. Guanidinhydroklorid är kaotropiskt och ett av denatureringsmedel som används i fysikalisk-kemiska studier av proteinveckning.
Figur 01: Guanidinhydroklorid
Guanidinhydroklorid har också förmågan att minska enzymaktiviteten och öka lösligheten av hydrofoba molekyler. Norm alt, vid högre koncentrationer av guanidinhydroklorid, förlorar proteiner sin ordnade struktur. Proteiner tenderar att bli slumpmässigt lindade vid denna koncentration av guanidinhydroklorid. I medicinska eller sjukhusmiljöer är guanidinhydroklorid indicerat för att minska symtomen på muskelsvaghet och lätt utmattning i samband med sjukdomen Eaton-Lamberts syndrom. Dessutom kan biverkningar av att använda guanidinhydroklorid inkludera perist altik, diarré och dödlig benmärgsdämpning.
Vilka är likheterna mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid?
- Guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid är två olika typer av proteindenatureringsmedel.
- Båda denatureringsmedlen har guanidin i sina strukturer.
- De är kaotropa agenter.
- Båda denatureringsmedlen kan användas för RNA-isolering.
- De används båda i medicinska eller sjukhusinstallationer.
Vad är skillnaden mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid?
Guanidintiocyanat är ett starkare proteindenaturerande medel som är vanligare vid RNA-isolering, medan guanidinhydroklorid är ett svagare proteindenatureringsmedel som används mindre vanligt vid RNA-isolering. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid. Dessutom är den kemiska formeln för guanidintiocyanat C2H6N4S, medan den kemiska formeln av guanidinhydroklorid är CH5N3HCl.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Guanidintiocyanat vs Guanidinhydroklorid
Guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid är två olika typer av proteindenatureringsmedel. Båda denatureringsmedlen är kaotropa. Guanidintiocyanat är ett starkare proteindenatureringsmedel som används mer allmänt vid RNA-isolering, medan guanidinhydroklorid är ett svagare proteindenatureringsmedel som används mindre vanligt vid RNA-isolering. Så detta sammanfattar skillnaden mellan guanidintiocyanat och guanidinhydroklorid.
