Integralproteiner vs perifera proteiner
Proteiner betraktas som makromolekyler, som består av en eller flera polypeptidkedjor. Polypeptidkedjorna är uppbyggda av aminosyror som är sammanbundna med peptidbindningar. Den primära strukturen av ett protein kan bestämmas av aminosyrasekvensen. Vissa gener kodar för många proteiner. Dessa gener bestämmer aminosyrasekvensen och bestämmer därigenom deras primära struktur. Integrala och perifera proteiner betraktas som "plasmamembranproteiner" på grund av deras förekomst. Dessa proteiner är i allmänhet ansvariga för en cells förmåga att interagera med den yttre miljön.
Integral Protein
Integralproteiner finns huvudsakligen antingen helt eller delvis nedsänkta i fosfolipidernas dubbelskikt i plasmamembranet. Dessa proteiner har både polära och icke-polära regioner på sig. Polära huvuden sticker ut från ytan av dubbelskiktet medan icke-polära områden är inbäddade i det. Vanligtvis interagerar endast de opolära områdena med den hydrofoba kärnan i plasmamembranet genom att skapa hydrofoba bindningar med fosfolipidernas fettsyrasvansar.
De integrerade proteinerna som spänner över hela membranet från den inre ytan till den yttre ytan kallas transmembranproteiner. I transmembranproteiner är båda ändarna som skjuter ut ur lipidskiktet polära eller hydrofila regioner. Mellanregionerna är opolära och har hydrofoba aminosyror på sin yta. Tre typer av interaktioner hjälper till att bädda in dessa proteiner i lipiddubbelskiktet, nämligen joniska interaktioner med de polära huvudena av fosfolipidmolekyler, hydrofoba interaktioner med de hydrofoba svansarna av fosfolipidmolekyler och specifika interaktioner med vissa regioner av lipider, glykosyralipider eller oligosacharider.
Perifert protein
Perifera proteiner (extrinsiska proteiner) finns på det innersta och yttersta av fosfolipidernas dubbelskikt. Dessa proteiner är löst bundna till plasmamembranet antingen direkt genom interaktioner med polära huvuden av fosfolipider i dubbelskikt eller indirekt genom interaktioner med integrerade proteiner. Dessa proteiner utgör cirka 20-30 % av totala membranproteiner.
De flesta av de perifera proteinerna finns på membranets innersta yta eller cytoplasmatiska yta. Dessa proteiner förblir bundna av antingen genom kovalenta bindningar med fettkedjor eller genom en oligosackarid till fosfolipider.
Vad är skillnaden mellan integr alt och perifert protein?
• Perifera proteiner förekommer på ytan av plasmamembranet medan integrala proteiner förekommer antingen helt eller delvis nedsänkta i lipidskiktet av plasmamembranet.
• Perifera proteiner är löst bundna till lipiddubbelskiktet och interagerar inte med den hydrofoba kärnan mellan två skikt av fosfolipider. Däremot är integrala proteiner tätt bundna och interagerar direkt med den hydrofoba kärnan i plasmamembranet. På grund av dessa skäl är integral proteindissociation svårare än perifera proteiner.
• Milda behandlingar kan användas för att isolera perifera proteiner från plasmamembranet, men för isolering av integrala proteiner räcker inte milda behandlingar. För att bryta de hydrofoba bindningarna krävs rengöringsmedel. Således kan integrala proteiner isoleras från plasmamembranet.
• Efter isolering av dessa två proteiner från plasmamembranet kan perifera proteiner lösas i neutrala vattenh altiga buffertar medan integrala proteiner inte kan lösas i neutrala vattenh altiga buffertar eller aggregat.
• Till skillnad från perifera proteiner är integralproteiner associerade med lipid när de solubiliseras.
• Exempel på perifera proteiner är spektrin av erytrocyter, cytokrom C och ATP-as från mitokondrier och acetylkolinesteras i elektroplaxmembran. Exempel på integrala proteiner är membranbundna enzymer, läkemedels- och hormonreceptorer, antigen och rhodopsin.
• Integralproteiner representerar cirka 70 % medan perifera proteiner representerar den återstående delen av plasmamembranproteiner.
