nyckelskillnad – rotat vs orotat fylogenetiskt träd
Fylogeni är ett viktigt område som utforskar livet på jorden genom tiden. Den avslöjar sambandet mellan organismer med deras förfäder och ättlingar. Relationerna mellan organismer representeras schematiskt av olika trädliknande representationer såsom dendogram, kladogram, fenogram, fylogram, etc. Ett fylogenetiskt träd är ett förgrenande trädliknande diagram som förklarar de fylogenetiska förhållandena mellan organismer med mängden evolutionärt avstånd. Det finns två huvudtyper av fylogenetiska träd som kallas rotade och orotade. Den viktigaste skillnaden mellan det rotade och orotade fylogenetiska trädet är att det rotade trädet visar den mest basala förfadern till trädet medan det orotade fylogenetiska trädet inte visar en förfäders rot.
Vad är ett rotat fylogenetiskt träd?
Ett rotat fylogenetiskt träd fungerar som ett användbart diagram som visar evolutionens historia. Den har en basal nod som kallas roten, som representerar den gemensamma förfadern till alla grupper i trädet. Roten till ett träd anses vara den äldsta punkten i trädet som representerar den sista gemensamma förfadern av alla grupper som ingår i trädet. Därför visar ett rotat träd riktningen för evolutionär tid. Från en enda art av ett rotat träd kan den gemensamma anor eller artens förfader hittas genom att spåra tillbaka till basalknuten. Eftersom det rotade trädet skildrar utvecklingstidens riktning är det lätt att hitta de äldre eller nyare grupper som det har. Ett rotat träd kan användas för att studera hela grupperna av organismer. Noggrann rotning av ett fylogenetiskt träd är en viktig och avgörande faktor eftersom felaktig rotsättning kan resultera i felaktiga tolkningar av genetiska förändringar mellan organismer och deras riktning av evolutionen.
Figur 01: Ett rotat fylogenetiskt träd
Vad är ett orotat fylogenetiskt träd?
Ett orotat fylogenetiskt träd är ett fylogenetiskt diagram som saknar en gemensam förfader eller en basal nod. Denna typ av träd indikerar inte ursprunget till utvecklingen av intressegrupperna. Den skildrar endast förhållandet mellan organismer, oavsett riktningen på den evolutionära tidslinjen. Därför är det svårt att studera gruppernas evolutionära relationer med avseende på tid med hjälp av ett orotat träd.
Det finns två huvudsakliga sätt att rota ett orotat fylogenetiskt träd. De är
Hitta en utgrupp – Detta kräver förkunskaper om relationerna mellan taxa. Sedan kan ett taxon som ligger utanför gruppen användas som en utgrupp för att rita ett rotat fylogenetiskt träd
Hitta mittpunkten eller avståndet – Mittpunkten för de två mest avlägsna taxorna i trädet kan antas vara en rot för det fylogenetiska trädet
Figur 02: Ett orotat fylogenetiskt träd
Vad är skillnaden mellan rotat och ogorött fylogenetiskt träd?
Rooted vs Unrooted Phylogenetic Tree |
|
| Ett rotat fylogenetiskt träd är ett diagram som visar den sista gemensamma förfadern till grupperna. | Ett orotat fylogenetiskt träd visar relationerna mellan organismer utan att visa den gemensamma förfadern. |
| Node | |
| Den har en nod (root). | Den har ingen nod. |
| Evolutionsriktning | |
| Den har en riktning för att indikera den evolutionära tiden. | Det anger inte ett evolutionärt förhållande. |
| Attityd mot andra | |
| Träet gör det möjligt att bestämma anfader-ättlingförhållandet mellan grupper. | Trädet tillåter inte att tala om anfader-ättling-förhållande. |
Sammanfattning – rotat vs orotat fylogenetiskt träd
Ett fylogenetiskt träd representerar evolutionära vägar och kopplingar mellan organismer med hjälp av ett grenat trädliknande diagram. Fylogenetisk träd kan vara rotad eller orotad. Ett rotat träd har en nod vid basen, som representerar den gemensamma förfadern som förbinder alla intressegrupper. Ett orotat träd visar relationerna mellan organismer. Den skildrar dock inte den gemensamma förfader som alla grupper delar. Detta är skillnaden mellan rotat och orotat fylogenetiskt träd.
