nyckelskillnad – allmänna kontra specifika transkriptionsfaktorer
Transkriptionsfaktorer krävs av RNA-polymeras för att verka på DNA-mallsträngen vid syntetisering av mRNA. Det finns olika typer av transkriptionsfaktorer. Dessa transkriptionsfaktorer bildar ett komplex med DNA-strängen. De ändrar antingen bekräftelsen av mallsträngen eller ökar affiniteten hos RNA-polymerasenzymet till mRNA-syntes i processen som kallas transkription. Det finns två huvudtyper av transkriptionsfaktorer. De är allmänna eller basala transkriptionsfaktorer och de specifika transkriptionsfaktorerna. De allmänna transkriptionsfaktorerna är de faktorer som används för att bilda pre-initieringskomplexet under transkriptionsprocessen. De finns i nästan alla eukaryoter, och i prokaryoter bildar de ett mindre komplicerat komplex. De specifika transkriptionsfaktorerna är antingen förstärkare eller repressorer, som är specifika DNA-sekvenser som aktiverar eller undertrycker den allmänna transkriptionsprocessen. Vissa specifika transkriptionsfaktorer kan förändra själva DNA-sekvensen. Den viktigaste skillnaden mellan de allmänna transkriptionsfaktorerna och de specifika transkriptionsfaktorerna är baserad på funktionaliteten. Allmänna transkriptionsfaktorer är involverade i bildandet av ett pre-initieringskomplex av transkriptionsprocessen, medan specifika transkriptionsfaktorer deltar i att antingen aktivera eller undertrycka transkriptionsprocessen.
Vad är allmänna transkriptionsfaktorer?
Allmänna eller basala transkriptionsfaktorer är de faktorer som är involverade i bildandet av initieringskomplexet under transkription. De är viktiga för transkriptionsprocessen och spelar därför en viktig roll i den framgångsrika transkriptionen. Det finns sex viktiga allmänna transkriptionsfaktorer. Dom är; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIE, TFIIF och TFIIA. De spelar olika roller under bildandet av initieringskomplexet.
- TFIID – Denna transkriptionsfaktor (TF) är involverad i att känna igen promotorsekvensen (TATA-rutan).
- TFIIB – Promotor-/TFIID-komplexet känns igen av TFIIB. Detta ger en signal för bindningen av det huvudsakliga katalyserande enzymet RNA-polymeras.
- TFIIF – Denna transkriptionsfaktor är bunden till RNA-polymeraset. TFIIF deltar alltså i processen genom att rekrytera RNA-polymeraset till rätt plats.
- TFIIE och TFIIH – Bindningen av dessa transkriptionsfaktorer markerar slutet på bildningen av pre-initieringen Bindning av dessa ökar effektiviteten i bildningen av pre-initieringskomplexet.
- TFIIA främjar bindningen av TFIID till TATA-boxen.
Figur 01: Allmänna transkriptionsfaktorer
De ovan nämnda allmänna transkriptionsfaktorerna är specifika för RNA-polymeras II, vilket är den typ av RNA-polymeras som förlänger mRNA-strängen. Det finns allmänna transkriptionsfaktorer involverade i RNA-polymeras I och III. Allmänna transkriptionsfaktorer kan också skilja sig åt beroende på vilken typ av cell den verkar på.
Vad är specifika transkriptionsfaktorer?
Specifika transkriptionsfaktorer är regioner som också finns i DNA-sekvenserna. De är oftast antingen förstärkare eller repressorer. Specifika transkriptionsfaktorer är de specifika cis-verkande elementen i mall-DNA-strängen som genomgår transkription. Aktivering av dessa specifika förstärkare och repressorer deltar i att öka enzymets affinitet genom att ändra orienteringen av DNA-molekylen eller genom att fungera som signalregioner. Specifika transkriptionsfaktorer används också för att inducera modifieringar av DNA-mallsträngen. Dessa modifieringar involverar huvudsakligen kovalenta modifieringar såsom metylering. Därigenom fungerar metylerade DNA-regioner som speciella förstärkare eller repressorer av transkriptionsprocessen.
Figur 02: Specifika transkriptionsfaktorer
De specifika transkriptionsfaktorerna beror på typen av art och är inte vanligt förekommande i alla eukaryoter. Dessa transkriptionsfaktorer aktiveras av olika metaboliska förhållanden via sign altransduktionsvägar. Vid aktivering reglerar de uttrycket av genen på en transkriptionsnivå.
Vilka är likheterna mellan allmänna och specifika transkriptionsfaktorer?
- Båda faktorerna krävs i processen för transkription.
- Båda faktorerna påverkar genuttrycket hos en organism.
- Båda faktorerna hjälper till att reglera funktionen av RNA-polymeras i transkriptionsprocessen.
- Båda faktorerna finns mestadels i eukaryoter.
Vad är skillnaden mellan allmänna och specifika transkriptionsfaktorer?
Allmän vs specifik transkription |
|
| De allmänna transkriptionsfaktorerna är de faktorer som används för att bilda förinitieringskomplexet under transkriptionsprocessen. | De specifika transkriptionsfaktorerna är antingen förstärkare eller repressorer, som är specifika DNA-sekvenser som aktiverar eller undertrycker den allmänna transkriptionsprocessen. |
| Typ av molekyl | |
| Allmänna transkriptionsfaktorer är proteinbaserade. | Specifika transkriptionsfaktorer är nukleotidsekvenser. |
| Formation | |
| Allmänna transkriptionsfaktorer bildar förinitieringskomplexet under transkriptionsinitieringen. | Specifika transkriptionsfaktorer fungerar som förstärkare eller undertryckare av transkription. |
| Typer | |
| Det finns sex huvudtyper; TFIID, TFIIB, TFIIH, TFIIF, TFIIE och TFIIA för allmänna transkriptionsfaktorer. | Specifika transkriptionsfaktorer kategoriseras huvudsakligen som förstärkare och repressorer. |
Sammanfattning – Allmänna kontra specifika transkriptionsfaktorer
Transkriptionsfaktorer är väsentliga för transkriptionsreglering och krävs för ökad effektivitet och noggrannhet i processen. Transkriptionsfaktorer är två huvudtyper; Allmänt/Bas alt och specifikt. Allmänna transkriptionsfaktorer är involverade i bildningen av pre-initieringskomplexet under transkription, medan specifika transkriptionsfaktorer är regioner i själva DNA:t som fungerar som förstärkare eller repressorer. Allmänna transkriptionsfaktorer är proteinbaserade och krävs av alla eukaryoter. Det varierar inte mycket och förblir som enhetliga molekyler. En specifik transkriptionsfaktor kan variera mycket och beror på individens genetiska sammansättning. Detta är skillnaden mellan allmänna och specifika transkriptionsfaktorer.
Ladda ned PDF-versionen av General vs Specific Transcription Factors
Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citat. Ladda ner PDF-versionen här Skillnaden mellan allmänna och specifika transkriptionsfaktorer
