nyckelskillnad – eukaryota vs prokaryota promotorer
Transkription är processen att omvandla den genetiska informationen som lagras i den kodande DNA-sekvensen till mRNA-sekvens. En specifik DNA-region belägen vid 5'-änden av transkriptionsenheten initierar denna process. Den regionen är känd som promotorregionen. Dessa promotorer finns typiskt intill transkriptionsstartstället. Längden på en promotor varierar från 100 bp till 1000 bp. Promotorer är olika beroende på typen av organism. Eukaryota och prokaryota promotorer skiljer sig från varandra. I prokaryoter finns endast tre typer av promotorsekvenser, nämligen -10 promotorer, -35 promotorer och uppströmselement. I eukaryoter finns det många olika promotorelement såsom TATA-box, initiatorelement, GC-box, CAAT-box, etc. Detta är den viktigaste skillnaden mellan eukaryota och prokaryota promotorer.
Vad är eukaryota promotorer?
Tre huvudportioner; kärnpromotor, proximal promotor och distal promotor, bildar tillsammans en promotor. I samband med eukaryoter finns det många antal promotorelement som är mycket sofistikerade och mer olika än promotorer. Det har visat sig att, på grund av denna komplexitet hos de eukaryota promotorerna, har DNA:t förmågan att vika tillbaka på sig själv. Detta förklarar också det faktum att effekten av många regulatoriska sekvenser äger rum trots att de är belägna många kilobaser bort från transkriptionsstället. Dessa eukaryota promotorer har förmågan att spänna igenom ett brett spektrum av DNA-sekvenser.
Figur 01: Eukaryotic Promoter
Exempel på vissa eukaryota promotorer är Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box etc. I samband med TATA-box är det en sekvens av 5' – TATAA -3' som finns i kärnan promotorregion. Till TATA-boxen är transkriptionsfaktorproteiner och histonproteiner bundna. Bindningen av transkriptionsfaktorproteiner till TATA-boxen hjälper till med bindningen av RNA-polymeras, vilket sedan resulterar i bildandet av transkriptionskomplex. Enkelt uttryckt kommer bindningen av dessa proteiner att driva transkriptionsprocessen. Denna process kommer att hämmas när histonproteiner binds till TATA-boxen. Därför är TATA-boxen ett viktigt promotorelement som involverar reglering av hastigheten för eukaryot transkription.
Vad är prokaryota promotorer?
I prokaryota organismer identifieras promotorn som är involverad i transkription av den associerade faktorn som kallas sigmafaktor. Sigmafaktorer är unika för olika promotorsekvenser. Därför sägs det att varje enskild sigmafaktor skulle känna igen en enda kärnpromotorsekvens. Detta är en unik egenskap som finns i den prokaryota transkriptionsprocessen. Både RNA-polymeras och sigmafaktorn identifierar tillsammans den korrekta promotorregionen och bildar transkriptionskomplexet.
Den prokaryota promotorn innehåller endast tre typer av promotorelement. Den mindre involveringen av promotorelement i prokaryoter är huvudorsaken till att deras transkriptionsprocess är mindre sofistikerad jämfört med eukaryot transkription som involverar ett högre antal promotorsekvenser. Av de tre promotorelementen i prokaryoter finns det två viktiga två korta DNA-sekvenser. Dessa sekvenser klassificeras efter deras plats. De är -10 promotorer eller element (som är närvarande 10 bp uppströms om transkriptionsstartstället), -35 promotorer eller element (som är närvarande 35 bp uppströms om transkriptionsstartstället).
Figur 02: Prokaryotisk promotor
Promotorn -10 motsvarar den eukaryota TATA-boxen eller Pribnow-boxen och är en väsentlig komponent för initiering av transkription i prokaryoter. -35-promotorn består av en sekvens som är TTGACA som aktivt involverar i regleringen av hastigheten för prokaryotisk transkription.
Vilka är likheterna mellan eukaryota och prokaryota promotorer?
- I båda typerna styrs promotorerna av olika DNA-regulatoriska sekvenser som inkluderar förstärkare, ljuddämpare, isolatorer och gränselement.
- Promotorer är de sekvenser som initierar transkription i prokaryoter och eukaryoter.
- Promotorer är DNA-sekvenser.
Vad är skillnaden mellan eukaryota och prokaryota promotorer?
Eukaryota vs Prokaryota Promoters |
|
| Eukaryota promotorer är de reglerande sekvenser som initierar transkriptionen av eukaryota organismer. | Prokaryota promotorer är de reglerande sekvenser som initierar transkriptionen av prokaryota gener. |
| Elements | |
| Prokaryotisk promotor består av uppströmselement, -10 element och -35 element. | Eukaryotisk promotor består av Pribnow-box (TATA-box), CAAT-box, GC-box och initiatorelement. |
Sammanfattning – eukaryota vs prokaryota promotorer
En promotor är en region av DNA som involverar initieringen av processen som kallas transkription. Dessa promotorer finns typiskt uppströms till transkriptionsstartstället. De tre huvuddelarna som bildar en promotor är kärnpromotor, proximal promotor och distal promotor. I samband med eukaryoter finns det många antal främjande element i promotorregionen som är mycket sofistikerade och mer olika än prokaryoter. Exempel på några eukaryota promotorelement är Pribnow-box (TATA-box), GC-box, CAAT-box etc. I prokaryoter finns det två viktiga promotorelement nämligen -10 element (som finns 10bp uppströms om transkriptionsstartplatsen), -35 element (det är närvarande 35 bp uppströms från startplatsen för transkription). -10-promotorn initierar transkriptionen och -35-promotorn reglerar transkriptionen. Båda typerna av promotorer kontrolleras av olika DNA-regulatoriska sekvenser som inkluderar förstärkare, ljuddämpare, isolatorer och gränselement. Detta är skillnaden mellan eukaryota och prokaryota promotorer.
Ladda ned PDF-filen för Eukaryotic vs Prokaryotic Promoters
Du kan ladda ner PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citat. Ladda ner PDF-versionen här: Difference Between Eukaryotic and Prokaryotic promoter
