Den viktigaste skillnaden mellan protomerer och kapsomerer är att protomerer är strukturella enheter av oligomera proteiner medan kapsomerer är individuella proteiner sammansatta av protomerer, som är strukturella subenheter av den virala kapsiden.
Ett virus är en intracellulär obligat parasit, som är en smittsam partikel. Kapsiden är en av de två huvudkomponenterna i en viruspartikel. Det är ett proteinhölje som omger och skyddar det virala genomet. En kapsid består av protomerer, som är de strukturella enheterna av oligomera proteiner. Capsomere är en strukturell underenhet av den virala kapsiden, och den är en aggregering av flera protomerer som en enhet. Protomerer monteras således själv för att bilda en kapsomer och kapsomerer själva för att bilda en kapsid.
Vad är protomers?
Protomerer är de strukturella enheterna av oligomera proteiner. Protomer innehåller minst två olika polypeptidkedjor. Oftare innehåller de flera polypeptider. I virala kapsider monteras protomerer själv för att bilda kapsomerer, som är de morfologiska enheterna av kapsider. Protomers ansluter till varandra via specifika bindningar och självmonterar.
Figur 01: Protomers
I tobaksmosaikviruset aggregeras protomerer för att bilda en tvåskiktsskiva för att omsluta RNA-genomet. Sålunda bildar dessa protomerer av tobaksmosaikvirus slutligen ett långt styvt ihåligt rör, vilket ger det ett spiralformat utseende. I ikosaedrisk symmetri aggregerar protomererna till enheter om fem eller sex kapsomerer och kondenserar sedan till 20 ytor av liksidiga trianglar och 20 toppar.
Vad är Capsomeres?
Kapsomerer är de strukturella proteinsubenheterna i den virala kapsiden. De är också de morfologiska underenheterna av virus. Strukturellt är kapsiden en sammansättning av kapsomerer. Varje kapsomer har flera protomerer som är självmonterade med varandra. Dessutom är kapsomerer anordnade på olika sätt i kapsiden för att ge en form åt den virala kapsiden. I detta avseende är spiralformade, ikosaedriska och komplexa de tre typerna av kapsomerarrangemang i virus. Arrangemanget av kapsomerer är emellertid karakteristiskt för ett visst virus. Kapsomerer förenas med varandra via interkapsomera triplexar som består av två kopior av ett protein och en kopia av ett annat.
Figur 02: Capsomeres
Dessutom har varje virus ett begränsat antal kapsomerer. Hepatit B-virus har en ikosaedrisk kapsid som innehåller 180 kapsomerer. Rekombinant adenovirus har en kapsid som innehåller 252 kapsomerer. Herpesvirus har 162 kapsomerer i sina kapsider. Dessutom har enterovirus 60 kapsomerer i sin kapsid. Likaså har olika virus olika antal kapsomerer i sitt proteinskal.
Capsomeres fyller flera funktioner i virus. Kapsomerer skyddar det virala genomet från fysiska, kemiska och enzymatiska skador. Dessutom är kapsomerer viktiga för att introducera ett vir alt genom i värden genom att lätt adsorberas till värdcellsytor.
Vilka är likheterna mellan protomerer och kapsomerer?
- Protomerer och kapsomerer är proteinstrukturer.
- Protomerer är underenheter till kapsomerer medan kapsomerer är underenheter till den virala kapsiden.
- Både protomerer och kapsomerer kan självmontera.
Vad är skillnaden mellan protomerer och kapsomerer?
Protomerer är de strukturella enheterna som gör oligomera proteiner medan kapsomerer är de morfologiska enheterna av virala kapsider. Så detta är nyckelskillnaden mellan protomerer och kapsomerer. Dessutom aggregerar protomerer för att bilda kapsomerer medan kapsomerer aggregerar för att bilda kapsid.
Infografiken nedan sammanfattar skillnaden mellan protomerer och kapsomerer.
Sammanfattning – Protomers vs Capsomeres
Protomerer är underenheter av kapsomerer medan kapsomerer är proteinsubenheter av den virala kapsiden. Således är kapsomer en aggregation av protomerer medan kapsid är en aggregation av kapsomerer. Arrangemang av protomerer eller arrangemang av kapsomerer ger form eller symmetri till ett visst virus. Baserat på kapsomerarrangemang är spiralformade och icosaedriska två former eller symmetrier som ses i virus. Så detta sammanfattar skillnaden mellan protomerer och kapsomerer.
