Nyckelskillnaden mellan snRNA och snoRNA är att snRNA involverar alternativ splitsning av pre-mRNA medan snoRNA involverar modifiering av rRNA och tRNA, mRNA-redigering och genomprägling.
Små RNA är polymera RNA-molekyler som består av mindre än 200 nukleotider. De är vanligtvis icke-kodande. De finns bland budbärar-RNA för att bära signaler. Små RNA härstammar från perfekt dubbelsträngat RNA, som produceras genom verkan av RNA-beroende RNA-polymeras. Små RNA spelar en viktig roll i celldifferentiering, tillväxt och proliferation, apoptos, metabolism, migration och försvar. Därför är små RNA viktiga och kritiska regulatorer av utveckling och fysiologi. Litet nukleärt RNA och litet nukleolärt RNA är två klasser av små RNA-molekyler.
Vad är snRNA?
Små kärn-RNA eller snRNA är en klass av små RNA-molekyler som finns i kärnan i eukaryota celler. Medellängden av ett snRNA är cirka 150 nukleotider. RNA-polymeras II eller RNA-polymeras III transkriberar snRNA. Huvudfunktionen för snRNA är bearbetningen av pre-budbärar-RNA i kärnan. De hjälper också till att reglera transkriptionsfaktorer eller RNA-polymeras II och bibehålla telomerer.
Figur 01: Verkningsmekanism för små RNA
Det finns två klasser av snRNA baserade på vanliga sekvensegenskaper och associerade proteinfaktorer såsom RNA-bindande LSm-protein. De två klasserna är Sm-klass snRNA och Lsm-klass snRNA. Sm-klass snRNA består av höga uridinh alter av U1, U2, U4, U4atac, U5, U7, U11 och U12. RNA-polymeras II transkriberar snRNA av SM-klass. Efter transkriptionen av pre-snRNA får de vanligtvis ett 7-metylguanosin 5'-lock i kärnan. Sedan exporteras de till cytoplasman genom kärnporer för vidare bearbetning. Lsm-klass snRNA har en hög uridinh alt av U6 och U6atac. RNA-polymeras III transkriberar snRNA av Lsm-klass och lämnar inte kärnan. De vanligaste mänskliga snRNA-komponenterna är U1 spliceosomal RNA, U2 spliceosomal RNA, U4 spliceosomal RNA, U5 spliceosomal RNA och U6 spliceosomal RNA.
Vad är snoRNA?
Små nukleolärt RNA eller snoRNA är en klass av små RNA-molekyler som styr kemiska modifieringar i annat RNA som ribosom alt RNA, transfer-RNA och litet nukleärt RNA. Varje snoRNA-molekyl är associerad med cirka fyra kärnproteiner i RNA/proteinkomplex under modifieringsprocessen. SnoRNA innehåller ett antisenselement som är runt 10-20 nukleotider. Dessa baser är komplementära till sekvensen som omger nukleotiderna som riktar sig mot modifieringen i pre-RNA-molekylen.
Figur 02: Litet nukleolärt RNA
Det finns två klasser av snoRNA. De är C/D box snoRNA och H/ACA box snoRNA. C/D box snoRNA är associerat med metylering och H/ACA box snoRNA är associerat med pseudo-uridylering. Varje snoRNA-molekyl fungerar som en guide för en eller två modifieringar i ett mål-RNA. C/D-box snoRNA innehåller två korta konserverade sekvensmotiv C och D, nära 5'- respektive 3'-ändarna av snoRNA. Korta regioner bestående av 5 nukleotider anordnas uppströms om C-boxen och nedströms om D-boxen och bildar en stam-box-struktur. Detta bringar C- och D-boxmotiven nära varandra. Stamboxstruktur är viktig för korrekt snoRNA-syntes och nukleolär lokalisering. H/ACA box snoRNA har en sekundär struktur som består av två hårnålar och två enkelsträngade regioner. Detta är allmänt känt som hårnål-gångjärn-hårnål-svans-strukturen. H/ACA box snoRNA består också av två konserverade motiv H och ACA. Båda är belägna i enkelsträngade regioner. H-lådan är i gångjärnet och ACA är i svansområdet. Tre nukleotider bildar 3'-änden av sekvensen.
Vilka är likheterna mellan snRNA och snoRNA?
- snRNA och snoRNA är små RNA.
- Båda finns i eukaryota celler.
- Båda är icke-kodande RNA-molekyler.
- Dessutom deltar de i att modifiera RNA under transkriptionsprocessen.
Vad är skillnaden mellan snRNA och snoRNA?
snRNA deltar i alternativ splitsning av pre-mRNA medan snoRNA huvudsakligen modifierar RNA-molekyler. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan snRNA och snoRNA. Dessutom är snRNA:n cirka 150 nukleotider långa och finns ofta kopplade till en grupp av proteiner och komplex som kallas små nukleära ribonukleoproteiner. snoRNA är cirka 60-170 nukleotider långa och finns huvudsakligen i kärnan.
Dessutom transkriberas snRNA av antingen RNA-polymeras II eller RNA-polymeras III, medan snoRNA endast transkriberas av RNA-polymeras II.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan snRNA och snoRNA i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – snRNA vs snoRNA
snRNA och snoRNA är klasser av små RNA-molekyler. snRNA deltar i alternativ splitsning av pre-mRNA medan snoRNA huvudsakligen modifierar RNA-molekyler. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan snRNA och snoRNA. Små RNA är polymera RNA-molekyler som består av mindre än 200 nukleotider långa och är vanligtvis icke-kodande. snRNA finns i kärnan av eukaryoter. snoRNA finns i archaea och eukaryoter. Transkription av snRNA sker genom RNA-polymeras II och II, medan endast RNA-polymeras II är involverat i att transkribera snoRNA. Så detta sammanfattar skillnaden mellan snRNA och snoRNA.
