Nyckelskillnaden mellan N-länkade och O-länkade oligosackarider är att N-länkade oligosackarider bildas när N-atomer av proteiner binder till ett socker, medan O-länkade oligosackarider bildas när O-atomer av serin eller treonin binder med en socker.
Oligosackarider är kolhydratmolekyler som innehåller tre till sex enheter monosackarider eller enkla sockerarter. N-länkade oligosackarider är kolhydratmolekyler där en oligosackarid är bunden till en kväveatom. O-länkade oligosackarider, å andra sidan, är en typ av kolhydrater där en sockermolekyl är fäst vid en syreatom av en serin- eller treoninrest i ett protein.
Vad är N-länkade oligosackarider?
N-länkade oligosackarider är kolhydratmolekyler vars oligosackarider är bundna till kväveatomer. Detta sker genom processen med N-glykosylering. Oligosackarider är kolhydratföreningar som innehåller flera sockermolekyler. Dessa kallas ibland "glykaner". I processen med N-kopplad glykosylering kommer kväveatomen vanligtvis från amidkvävet från en asparaginrest av ett protein. Denna process beskrivs bäst inom biokemi.
Vanligtvis sker N-kopplad glykosylering i många eukaryota proteiner. Bland eukaryoter förekommer detta allmänt i archaea men sällan i bakterier. Vi kan bestämma naturen hos den N-kopplade oligosackariden som är fäst vid ett glykoprotein genom proteinet och cellen i vilken det uttrycks. Typen av N-kopplad oligosackarid beror också på arten av organismer.
I ett glykoprotein finns det vanligtvis två bindningstyper: bindningen mellan sackaridrester i glykanen och bindningen mellan glykankedjan och proteinmolekylen. Där är sockerportioner bundna till varandra genom glykosidbindningar. Glykosidbindningarna är typiskt C1-C4-bindningar. Dessutom kräver bindningen mellan en oligosackarid och en proteinrest erkännande av en konsensussekvens.
Vad är O-länkade oligosackarider?
O-kopplade oligosackarider är en typ av kolhydrater där en sockermolekyl är fäst vid en syreatom i en serin- eller treoninrest i ett protein. Processen för denna bindningsbildning är känd som O-länkad glykosylering. Det är en post-transitional modifieringsprocess som äger rum efter syntesen av ett protein.
När man överväger eukaryoter, sker denna syntes i det endoplasmatiska retikulumet, Golgi-apparaten och ibland i cytoplasman. Hos prokaryoter sker detta i cytoplasman. Det finns flera olika typer av sockerarter som kan binda med serin eller treonin. Denna bindning kan påverka proteinet på olika sätt. T.ex. handel med celler i immunsystemet, vilket möjliggör igenkänning av främmande material.
Vad är skillnaden mellan N-länkade och O-länkade oligosackarider?
N-länkade oligosackarider är kolhydratmolekyler där oligosackariden är bunden till en kväveatom, medan O-länkade oligosackarider är en typ av kolhydrater där en sockermolekyl är bunden till en syreatom av en serin- eller treoninrest i en protein. Därför är den viktigaste skillnaden mellan N-länkade och O-länkade oligosackarider att N-länkade oligosackarider bildas när N-atomen i proteiner binder med ett socker medan O-länkade oligosackarider bildas när O-atomer av serin eller treonin binder med ett socker.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan N-länkade och O-länkade oligosackarider i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – N-länkade vs O-länkade oligosackarider
Oligosackarider är en typ av sockermolekyl. Den viktigaste skillnaden mellan N-länkade och O-länkade oligosackarider är att N-länkade oligosackarider bildas när N-atomer av proteiner binder till ett socker, medan O-länkade oligosackarider bildas när O-atomer av serin eller treonin binder med ett socker.
