Skillnaden mellan Cosmid och Phagemid beror på vilken typ av sekvenser den innehåller. En kosmid innehåller ett cos-ställe och en plasmid. Därför är det en hybridvektor medan en fagemid är en plasmid som innehåller ett F1-replikationsursprung för F1-fagen.
Kosmider och fagemider används för kloningsändamål, speciellt för att klona större fragment av DNA. Dessa används i stor utsträckning, särskilt vid kloning av gener som är ansvariga för produktionen av olika proteiner. Kosmider och fagemider replikeras antingen ensamma som plasmider eller förpackas i virala partiklar och replikeras sedan.
Vad är en Cosmid?
En kosmid, hänvisad till som en hybridplasmid, omfattar cos-ställen extraherade från Lambda-fagpartiklar och en plasmid. Dessa cos-ställen är långa fragment av DNA med 200 baspar. Därför har de sammanhängande eller klibbiga ändar som tillåter plasmiden att passa in i det virala DNA:t. Därför är cos-platserna avgörande för förpackning av DNA:t.
Det finns tre cos-sajter;
- cosN-plats – involverad i att hacka DNA-strängen genom terminasaktivitet
- cosB-webbplats – engagerad i att hålla terminasen.
- cosQ-plats – involverad i att förhindra nedbrytning av DNA av DNaser.
Figur 01: Cosmid
Cosmider kan också antingen replikera enkelsträngat DNA eller dubbelsträngat DNA med ett lämpligt replikationsursprung. Kosmider innehåller vanligtvis antibiotikaresistensgener som markörer för selektion av transformanter. Således kan användningen av en kosmid som vektor underlätta kloningen, och restriktionsenzymdigestionen av vektorn kan sedan extrahera dessa fragment.
Vad är en Phagemid (Phasmid)?
Phagemid, även kallad Phasmid, är också en typ av hybridvektor. Phagemid innehåller ett speciellt replikationsursprung som kallas fl-replikationsursprunget. replikationsursprunget f1 extraherar från en f1-fag.
Phagemid kan replikera både enkelsträngat och dubbelsträngat DNA. Replikation kan antingen ske som en plasmid medan den genomgår oberoende replikering eller kan packas till fagpartiklar och slutligen infektera bakterievärd E coli. När E coli-cellerna infekteras kräver f1-fagen närvaron av en pilus. Därför är sexpili viktiga under in vitro-förpackning av fagemider.
Vilka är likheterna mellan Cosmid och Phagemid?
- Både Cosmid och Phagemid är kloningsvektorer som används i rekombinant DNA-teknik.
- Cosmid och Phagemid kan replikera enkelsträngat och dubbelsträngat DNA.
- Båda kan genomgå oberoende replikering som liknar plasmider.
- Cosmid och Phagemid kan genomgå in vitro-förpackning och infektera bakterieceller.
- Både Cosmid och Phagemid kräver ett lämpligt replikationsursprung för kloning.
Vad är skillnaden mellan Cosmid och Phagemid?
Cosmid vs Phagemid |
|
| Cosmid är en hybridvektor som innehåller en cos-plats och en plasmid. | Phagemid är en plasmid som innehåller ett F1-replikationsursprung för F1-fagen. |
| Närvaro av Cos-webbplatser | |
| Cos-webbplatser finns i cosmid och är nödvändiga för in vitro-förpackning. | Cos-webbplatser saknas i fagemid. |
| Närvaro av F1 ursprung för replikering | |
| I cosmid kan fi-replikationsursprunget finnas eller inte. | F1 replikationsursprung finns i fagemid. |
| Närvaro av antibiotikaresistenta gener | |
| Antibiotikaresistenta gener finns i kosmider för att identifiera transformanter från icke-transformanter. | Antibiotikaresistenta gener saknas i fagemider. |
| Krav på in vitro-förpackning | |
| Kräver en cos-webbplats. | Kräver en sexpilus. |
Sammanfattning – Cosmid vs Phagemid
Cosmid och Phagemid är kloningsvektorer som används i rekombinant DNA-teknik. Kosmider är hybridvektorer som innehåller speciella klibbiga ändar som kallas cos-ställen. in vitro-förpackningar kräver dessa cos-platser. Medan fagemider är plasmider som innehåller ett fl-replikationsursprung extraherat från fl-fag. Både kosmid och fagemid kan genomgå oberoende replikering eller in vitro förpackning till bakterieceller. Det här är de viktiga skillnaderna mellan kosmid och fagemid.
