Den viktigaste skillnaden mellan PARP1 och PARP2 är att PARP1 för växt och djur bär Zn-finger DNA-bindande motiv medan växt PARP2 bär N-terminala SAP DNA-bindande motiv.
Poly ADP-ribospolymeras (PARP) är en familj av proteiner som är nukleära enzymer. Det finns 17 olika typer av PARP-enzymer i PARP-familjen. PARP1 och PARP2 är två enzymer som är nödvändiga för normala DNA-reparationsaktiviteter.
Vad är PARP?
PARP (Poly ADP-ribospolymeras) är en familj av proteiner som fungerar i många cellulära processer som DNA-reparation, genomisk stabilitet och programmerad celldöd. De katalyserar en process som kallas ADP-ribosylering. ADP-ribosylering avser tillägg av ADP-ribosenheter från nikotinamidadenindinukleotid (NAD) till målsubstrat för att reparera DNA-strängbrotten.
PARP-enzymer är DNA-bindande proteiner. De aktiveras av hackarna som finns i DNA-molekyler. När de väl binder med DNA-avbrott, hydrolyserar de NAD+ till nikotinamid och främjar polymerisationen av ADP-ribosen. Därför deltar PARP nukleära enzymer i DNA-reparation. Dessutom fungerar poly-ADP-ribosylering som en post-translationell modifiering som spelar en nyckelroll i replikation, transkriptionell reglering, telomerunderhåll och proteinnedbrytning. PARP-enzymer deltar också i upprätthållandet av genomets stabilitet, reglering av kromatinstruktur, cellproliferation och apoptos.
Vad är PARP1?
PARP1 är en medlem av PARP-proteinfamiljen. Det är det första och bäst karakteriserade proteinet i denna familj. Den fungerar som en första responder som upptäcker DNA-skador och sedan underlättar valet av reparationsmekanism. Dessutom reglerar PARP1 reparationen av enkelsträngade DNA-skador.
Figur 01: PARP1
Förutom att reparera enkelsträngade DNA-avbrott, reglerar PARP1 replikationsgaffelprogression och omstart. Dessutom främjar den alternativa icke-homologa ändsammanfogningar.
Vad är PARP2?
PARP2 är ett annat medlemsprotein i PARP-proteinfamiljen. Det är nära besläktat med PARP1-enzym. Genen PARP2 kodar för PARP2-protein hos människor. PARP2 har en katalytisk domän men saknar N-terminal DNA-bindande domän. PARP-hämmande läkemedel mot cancer kan hämma PARP2, liknande PARP1.
Figur 02: PARP2
I växter, särskilt i Arabidopsis thaliana, spelar PARP2 en betydande roll i skyddande svar på DNA-skador och bakteriell patogenes än PARP1.
Vilka är likheterna mellan PARP1 och PARP2?
- PARP1 och PARP2 är två typer av nukleära enzymer.
- De använder NAD+ som sitt substrat för att katalysera poly ADP-ribosylering.
- Båda aktiveras av DNA enkelsträngsbrott.
- Däggdjurs PARP1 och PARP2 är belägna i kärnan.
- Både PARP1 och PARP2 interagerar med kromatin.
- De reparerar DNA-skador.
- Vissa PARP-hämmande anticancerläkemedel riktade mot PARP1 hämmar också PARP2.
Vad är skillnaden mellan PARP1 och PARP2?
PARP1 är en medlem av PARP-proteinfamiljen som har en katalytisk domän och N-terminal DNA-bindande domän medan PARP2 är en medlem av PARP-familjen som saknar N-terminal DNA-bindande domän. Den viktigaste skillnaden mellan PARP1 och PARP2 är att PARP1 för växt och djur bär Zn-finger DNA-bindande motiv medan växt PARP2 bär N-terminala SAP DNA-bindande motiv.
Följande infografik sammanfattar skillnaden mellan PARP1 och PARP2.
Sammanfattning – PARP1 vs PARP2
PARP är nukleära enzymer som känner av DNA-skador och reparerar dem. PARP1 och PARP2 är två av dem som är nära besläktade. Båda enzymerna har en katalytisk domän. Men PARP2 saknar N-terminal DNA-bindande domän som finns i PARP1. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan PARP1 och PARP2. Båda typerna av enzymer använder NAD+ som substrat.