Nyckelskillnaden mellan isoschizomerer och neoschizomerer är att isoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens och klyver DNA i samma positioner, medan neoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens men som klyver DNA i olika positioner.
Restriktionsenzymer eller restriktionsendonukleaser är enzymer som klyver DNA till fragment vid eller nära specifika igenkänningsställen. De skär DNA vid restriktionsställen. Restriktionsenzymer klassificeras vanligtvis i fem grupper baserat på struktur, om de skär deras DNA-substrat vid deras igenkänningsställe och om igenkännings- och klyvningsställena är separata från varandra. Mer än 3600 restriktionsendonukleaser har redan identifierats. Cirka 800 restriktionsenzymer finns kommersiellt tillgängliga. Isoschizomerer och neoschizomerer är två typer av restriktionsenzymer baserade på igenkänningsställe och klyvningsspecificitet.
Vad är isoschizomerer?
Isoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens och klyver DNA i samma positioner. Dessa restriktionsenzymer har samma specificitet. Det första upptäckta restriktionsenzymet som känner igen en given sekvens är känt som en prototyp, medan alla efterföljande identifierade restriktionsenzymer som känner igen samma sekvens kallas isoschizomerer. Emellertid kan isoschizomerer skilja sig åt i platspreferenser, reaktionsförhållanden, metyleringskänslighet och stjärnaktivitet. Isoschizomerer isoleras från olika bakteriestammar. Därför kan de kräva olika reaktionsbetingelser. I vissa fall kan endast en av ett par isoschizomerer känna igen både metylerade och ometylerade former av restriktionsställen. Å andra sidan kan det andra restriktionsenzymet endast känna igen den ometylerade formen av restriktionsstället. Denna speciella egenskap hos isoschizomerer hjälper till att identifiera metyleringstillståndet för restriktionsstället samtidigt som det isoleras från ett bakteriellt tillstånd.
AgeI och BshT1 känner till exempel igen och klyver 5’-A↓CCGGT i samma mönster. HpaII och MSPI är andra par av isoschizomerer. De känner båda igen sekvens 5'-C↓CGG-3' när den är ometylerad. Men när det andra C:et i sekvensen är metylerat är det bara MSPI som kan känna igen denna sekvens medan HpaII inte kan känna igen den.
Vad är neoschizomerer?
Neoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens men klyver DNA i olika positioner. I vissa speciella molekylärbiologiska tillämpningar är detta en mycket användbar funktion. Neoschizomererna är en undergrupp av isoschizomerer. Välkända exempel på neoschizomerer är SmaI (5'-CCC↓GGG-3') och XmaI (5'-C↓CCGGG-3'); båda känner igen 5'-CCCGGG-3'-sekvensen men klyver dem i en annan position. Således genererar dessa två restriktionsenzymer olika typer av ändar. I det här fallet producerar SmaI trubbiga ändar och XmaI producerar 5' utskjutande ändar.
Figur 01: Neoschizomer
Ett annat exempel är MaeII- och Tail-restriktionsenzympar. Prototyp MaeII (A↓CGT) producerar DNA-fragment med en 2-bas 5'-förlängning, och neoschizomer Tail (ACGT↓) producerar DNA-fragment med en 4-bas3'-förlängning.
Vilka är likheterna mellan isoschizomerer och neoschizomerer?
- Isoschizomerer och neoschizomerer är två typer av restriktionsenzymer.
- De finns främst i prokaryoter.
- De är en del av restriktionsmodifieringssystemet (RM) som finns i bakterier och arkéer.
- Båda är proteinmolekyler.
- Båda klyver DNA till fragment.
Vad är skillnaden mellan isoschizomerer och neoschizomerer?
Isoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens och klyver DNA i samma positioner, medan neoschizomerer är restriktionsenzymer som har samma igenkänningssekvens men som klyver DNA i olika positioner. Så detta är nyckelskillnaden mellan isoschizomerer och neoschizomerer. Dessutom har isoschizomerer samma specificiteter medan neoschizomerer har olika specificiteter.
Följande infografik listar skillnaderna mellan isoschizomerer och neoschizomerer i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Isoschizomers vs Neoschizomers
Restriktionsenzymer är DNA-skärande enzymer. De kallas också molekylära saxar. Det finns olika typer av restriktionsenzymer. Baserat på igenkänningsstället och klyvningsspecificiteten är restriktionsenzymer två typer som isoschizomerer och neoschizomerer. Isoschizomerer har samma igenkänningssekvens och klyver DNA i samma positioner medan neoschizomerer har samma igenkänningssekvens men klyver DNA i olika positioner. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan isoschizomerer och neoschizomerer.
