Den viktigaste skillnaden mellan isoschizomerer och isokaudomerer är att isoschizomerer känner igen och klyver samma restriktions- eller igenkänningsplats medan isokaudomerer känner igen något olika restriktionsställen och klyver på samma plats.
Restriktionsenzymer eller restriktionsendonukleaser är en typ av nukleaser som klyver dubbelsträngat DNA. De kan känna igen specifika sekvenser som kallas restriktionsställen, som är palindromiska till sitt ursprung. Bakterier producerar restriktionsenzymer mot främmande patogener, speciellt mot virus. Det är en form av försvarsmekanism som visas av bakterier. Beroende på strukturen av enzymet och arten av snitt finns det tre typer av restriktionsenzymer som typ I restriktionsenzymer, typ II restriktionsenzymer och typ II restriktionsenzymer. Dessutom, beroende på den biokemiska aktiviteten och källan till isolering, finns det tre typer av restriktionsenzymer som isoschizomerer, neoschizomerer och isokaudomerer.
Vad är isoschizomerer?
Isoschizomerer är en typ av restriktionsenzym som kommer från olika källor men känner igen och klyver samma restriktionsställe i DNA. Därför har två isoschizomerer samma igenkänningsställe. De klyver på samma ställe, så de är specifika för samma igenkänningssekvens. Till exempel är restriktionsenzymer SphI och BbuI två isoschizomerer som känner igen och klyver vid CGTAC/G.
Figur 01: Restriktionsenzym
Ett annat par isoschizomerer är HpaII och MspI. De känner båda igen sekvensen 5′-CCGG-3′ och klyver DNA:t. Dessutom är BspEI och Acc III också isoschizomerer som kommer från en Bacillus-art respektive Acinetobacter calcoaceticus. Isolering av isoschizomerer kan göras från olika bakterier. Eftersom de kommer från olika bakterier kan deras restriktionsförhållanden vara olika.
Vad är isocaudomer?
Isocaudomerer är en typ av restriktionsenzym som känner igen lite olika sekvenser, men de klyver på samma ställe för att producera samma ändar. Isocaudomerer kommer också från olika bakterier. Sau3a och BamHI är ett par isokaudomerer. De producerar 5'-GATC-3' klibbiga ändar efter klyvning av samma ställe. Ett annat par isocaudomerer är NcoI från Nocardia corallina och PagI från Pseudomonas alcaligenes. Dessa två enzymer binder också vid olika igenkänningssekvenser men skär på samma ställe och producerar samma klibbiga ändar. Därför är producerande skärändar kompatibla med varandra, och de kan bindas till varandra. XhoI, PspXI och SalI är också isokaudomerer.
Vilka är likheterna mellan isoschizomerer och isocaudomerer?
- Isoschizomerer och isokaudomerer är två typer av restriktionsenzymer.
- Två isoschizomerer har samma matsmältningsställe, liknande två isocaudomerer som har samma matsmältningsställe.
- De är prokaryota till sitt ursprung.
- Båda har en plats för begränsningsigenkänning såväl som en matsmältningsplats.
- De producerar ändar som är kompatibla med varandra.
- Dessa enzymer är dessutom användbara verktyg i rekombinant DNA-teknik.
Vad är skillnaden mellan isoschizomerer och isocaudomerer?
Isoschizomerer är restriktionsenzymer som känner igen samma DNA-sekvens och klyver på samma restriktionsställe, medan isocaudomerer är restriktionsenzymer som känner igen lite olika DNA-sekvenser men producerar samma klibbiga ändar genom att skära på samma plats. Så detta är den viktigaste skillnaden mellan isoschizomerer och isokaudomerer.
Infografiken nedan visar skillnaden mellan isoschizomerer och isokaudomerer.
Sammanfattning – Isoschizomers vs Isocaudomers
Isoschizomerer är restriktionsenzymer som känner igen samma DNA-sekvens och klyver på samma ställe. Å andra sidan är isokaudomerer restriktionsenzymer som känner igen de något olika sekvenserna och klyver på samma ställe och producerar samma ändar. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan isoschizomerer och isokaudomerer. Sphl, BbuI, HpaII och MspI är flera exempel på isoschizomerer medan Sau3a och BamHI är två exempel på isokaudomerer. Både isoschizomerer och isokaudomerer produceras naturligt av bakterier.