Den viktigaste skillnaden mellan motiv och domän är att motivet inte är oberoende stabilt medan domänen är oberoende stabilt.
Proteiner är viktiga biologiska makromolekyler som finns i vår kropp. Å andra sidan kommer den genetiska koden för en gen att avgöra aminosyrasekvensen för ett protein. Dessutom har proteiner primära, sekundära och tertiära strukturer. Den primära strukturen är aminosyrasekvensen för polypeptidkedjan. När polypeptidkedjor viker sig med varandra bildar det proteinets sekundära struktur. Alfaspiraler, beta-ark och supersekundära strukturer tillhör de sekundära strukturerna. Vissa grupperingar av supersekundära element är kända som proteinmotiv. Den tertiära strukturen av ett protein hänvisar till dess tredimensionella struktur som bestämmer proteinets funktion. Domän är en vikt sektion av en proteinmolekyl, som är klotformig och har en diskret funktion. Det är den grundläggande funktionella och tredimensionella strukturen hos proteinet.
Vad är motiv?
Motif är en viss gruppering av de supersekundära elementen i proteiner som alfaspiraler och betastrukturer. De är något slags mönster som finns i olika proteiner. Motiv beskriver de sekundära strukturelementens vikningsmönster och deras interaktioner. Dessa vikningsmönster stabiliseras genom liknande kopplingar som finns i tertiära strukturer. De är dock inte lika komplexa som tertiära strukturer.
Figur 01: Motiv
De är enkla kombinationer av sekundära strukturer av proteiner. Motiv är inte stabilt i sig. Dessutom förklarar motiv strukturen av ett protein men förutsäger inte funktionen av ett protein. Exempel på proteinmotiv är ett beta-alfa-beta-motiv, grekiskt nyckelmotiv, Beta-fat, Beta-meander-motiv, etc.
Vad är domän?
Domän är en grundläggande, funktionell och tredimensionell enhet av ett protein. Den utför en viss funktion. Ett enda protein kan ha flera distinkta domäner. Varje domän är en oberoende enhet. Det är en klotformig struktur. Den ansvarar för en specifik funktion eller interaktion. Domäner kan användas för att anta funktionen hos ett okarakteriserat protein. När man analyserar ett protein är det viktigt att ta hänsyn till eftersom domäner är proteinets funktionella enheter.
Figur 02: Tre olika domäner av Pyruvate Kinase
Domäner är mycket stabila och kompakta strukturer. De kan lätt särskiljas från andra regioner. Pyruvatkinas har tre särskiljande domäner som visas i figur 02. Längden på domänen kan variera och medellängden är 100 aminosyror. Varje domän innehåller en hydrofob kärna byggd av sekundära strukturella enheter. Flera domäner bildar tillsammans den tertiära strukturen av ett protein.
Vilka är likheterna mellan motiv och domän?
- Motiv och domän är enheter som finns i själva proteinmolekylerna.
- De är användbara när man klassificerar proteinfamiljer.
Vad är skillnaden mellan motiv och domän?
Motif är en viss gruppering av de supersekundära elementen i proteiner som alfaspiraler och betastrukturer medan domän är den funktionella enheten i ett protein. Dessutom är motiv en sekundär struktur medan domänen är ansvarig för proteinets tertiära struktur. Dessutom är domän en oberoende enhet, till skillnad från ett motiv. Dessutom skildrar domän funktionen av ett protein medan motiv inte är det. Dessa är de viktigaste skillnaderna mellan motiv och domän. Infografiken nedan visar skillnaden mellan motiv och domän i tabellform.
Sammanfattning – Motiv kontra domän
Motif är ett arrangemang av sekundära strukturer av proteinmolekylen. Det är vanligtvis inte stabilt i sig, till skillnad från en domän. Domän är en oberoende stabil struktur av ett protein. Därför kan det vara en del eller hel proteinmolekyl. Det är en tredimensionell grundläggande funktionell enhet av proteinet. Dessutom har den en funktion, och den är en oberoende enhet. Motiv kan vara en del av domänen. Men domän kan inte vara en del av ett motiv. Det här är skillnaden mellan motiv och domän.
