Nyckelskillnaden mellan proteinsubenhet och domän är att en proteinsubenhet är en separat polypeptidkedja av ett protein som sätts samman med andra polypeptidkedjor för att bilda ett proteinkomplex medan en proteindomän är en sammanhängande region av polypeptidkedjan av ett protein som ofta viker sig oberoende till en kompakt, lokal och halvoberoende enhet.
Proteinsubenhet och -domän är mycket viktiga delar av ett multimert protein. Proteiner är polymerer gjorda av polypeptider. Varje polypeptidkedja byggs upp från en monomer som kallas en aminosyra. Ett komplext protein innehåller distinkta strukturella enheter såsom subenheter, domäner, motiv och veck. Dessa strukturella enheter i ett komplext protein är extremt viktiga för dess struktur och i slutändan för dess funktion.
Vad är en proteinsubenhet?
En proteinsubenhet är en separat polypeptidkedja av ett protein som sätts samman med andra polypeptidkedjor för att bilda ett proteinkomplex. I strukturell biologi är en proteinsubenhet en enda proteinmolekyl som sätts samman med andra proteinmolekyler för att bilda ett proteinkomplex. Naturligt förekommande proteiner har ett relativt litet antal subenheter, såsom hemoglobin och DNA-polymeras. Därför kallas de oligomera. Andra proteiner består av ett stort antal subenheter, så de beskrivs som multimera. Till exempel är mikrotubuli och andra cytoskelettproteiner multimera. Subenheterna av multimert protein kan vara identiska (homologa) eller helt olika (heterologa).
Figur 01: Proteinunderenhet
I vissa multimera proteiner kan en subenhet vara en katalytisk subenhet. Å andra sidan är den andra en reglerande underenhet. Funktionen hos den katalytiska subenheten är att katalysera den enzymatiska reaktionen medan funktionen hos den regulatoriska subenheten underlättar eller hämmar dess aktivitet. Ett enzym som består av både katalytiska och regulatoriska subenheter när det är sammansatt kallas vanligtvis ett holoenzym. Till exempel har enzymklass I fosfoinositid 3-kinas en p110 katalytisk subenhet och en p85 regulatorisk subenhet. Dessutom måste ett protein ha en gen för varje subenhet. Detta beror på att en underenhet är uppbyggd av en separat polypeptidkedja som har en kodande gen.
Vad är en proteindomän?
En proteindomän är en sammanhängande region av polypeptidkedjan i ett protein som ofta viker sig oberoende till en kompakt, lokal och halvoberoende enhet. Domänen av ett protein är också känd som en region av polypeptidkedjan av protein som är självstabiliserande och viker sig oberoende av resten. De är en distinkt strukturell och funktionell enhet i ett protein. Norm alt är domäner ansvariga för en specifik funktion eller en interaktion som bidrar till proteinets övergripande roll. Till exempel är SH3-domänen runt 50 aminosyrarester. De förekommer i en mängd olika proteiner, inklusive adapterproteiner, fosfatidylinositol3-kinaser, fosfolipaser och myosiner. Dessa SH3-domäner är involverade i protein-protein-interaktioner.
Figur 02: Proteindomäner
Domänerna varierar i längd från 50 aminosyror till 250 aminosyror. De kortaste domänerna, som zinkfinger, stabiliseras av metalljoner och disulfidbryggor. En domän producerar ofta funktionella enheter såsom den kalciumbindande EF-handdomänen av kalmodulin. Dessutom kan domäner bytas genom genteknik mellan ett protein till ett annat för att göra chimära proteiner.
Vilka är likheterna mellan proteinunderenhet och domän?
- Proteinsubenhet och -domän är strukturella enheter av ett multimert protein.
- Båda består av aminosyror.
- De är kopplade till termen "polypeptidkedja".
- Dessutom är de båda extremt viktiga för proteinets övergripande funktion.
Vad är skillnaden mellan proteinunderenhet och domän?
En proteinsubenhet är en separat polypeptidkedja av ett protein som sätts samman med andra polypeptidkedjor för att bilda ett proteinkomplex. Å andra sidan är en proteindomän en sammanhängande region av polypeptidkedjan av ett protein som ofta viker sig oberoende till en kompakt, lokal och semi-oberoende enhet. Så detta är nyckelskillnaden mellan proteinsubenhet och domän. Dessutom är en proteinsubenhet större i storlek än en proteindomän.
Följande tabell sammanfattar skillnaden mellan proteinunderenhet och domän i tabellform.
Sammanfattning – Proteinsubunit vs Domain
Byggstenarna i proteiner är aminosyror. Proteiner bildas genom kondensation av aminosyror. Proteinstrukturer varierar i storlek från tiotals till flera tusen aminosyror. En proteinstruktur stabiliseras av icke-kovalenta interaktioner såsom vätebindningar, jonbindningar, Van der Waals-krafter, hydrofoba bindningar och kovalenta interaktioner såsom disulfidbindningar. Ett komplext protein innehåller distinkta strukturella enheter såsom subenheter, domäner, motiv och veck. En proteinsubenhet är en separat polypeptidkedja av ett protein som sätts samman med andra polypeptidkedjor för att bilda ett proteinkomplex. Å andra sidan är proteindomänen en region av polypeptidkedjan av protein som är självstabiliserande och viker sig oberoende av resten. Detta är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan proteinsubenhet och domän.
