Den viktigaste skillnaden mellan TATA och CAAT-box är att TATA-box är en konserverad nukleotidregion som har en konsensussekvens av TATAWAW medan CAAT-box är en konserverad nukleotidregion med en konsensussekvens av GGCCAATCT.
TATA-box och CAAT-box är två regioner av nukleotider som påverkar transkriptionen av eukaryota gener. De är icke-kodande DNA-sekvenser som finns uppströms till transkriptionsinitieringsstället. Faktum är att de finns i den reglerande regionen, som är känd som promotorn. Både TATA-boxen och CAAT-boxen är ansvariga för effektiviteten av transkription. De är konsensussekvenser som inte har förändrats under hela evolutionsprocessen.
Vad är TATA Box?
TATA-box eller Goldberg-Hogness-box är en konsensussekvens som finns i promotorregionen för eukaryota gener. TATA-box är ett kärnelement i promotorn. Det är beläget 25 baspar uppströms om transkriptionsinitieringsstället. Det bevaras under hela evolutionsprocessen. Konsensussekvensen för TATA-boxen är TATAWAW, där W är antingen A eller T. Det är en icke-kodande DNA-sekvens. TATA-boxen är dock viktig för transkriptionen av genen. Det är bindningsstället för TATA-bindande protein (TBP) och andra transkriptionsfaktorer. När de väl binder till TATA-boxen sker rekryteringen av RNA-polymeras II och korrekt reglering av transkription i eukaryota gener.
Figur 01: TATA Box
Eftersom TATA-boxen är involverad i regleringen av transkription kan mutationer av TATA-boxen resultera i fenotypiska förändringar som leder till sjukdomar som magcancer, spinocerebellar ataxi, Huntingtons sjukdom, blindhet, β-talassemi, immunsuppression, Gilberts syndrom, och HIV-1, etc.
Vad är CAAT Box?
CAAT-rutan är en region av nukleotider med konsensussekvensen för GGCCAATCT. I likhet med TATA-box är CAAT-box också belägen i promotorregionen av genen. Därför ligger den cirka 75-80 baspar uppströms till transkriptionsplatsen.
Figur 02: CAAT Box
Specifika transkriptionsfaktorer binder till CAAT-rutan. Denna bindning stabiliserar förinitieringskomplexet för lättare bindning av enzymet RNA-polymeras. På samma sätt fungerar CAAT-boxen som en reglerande sekvens. Mutationer i CAAT-boxregionen påverkar i hög grad promotorsvaret och regleringen av transkription.
Vilka är likheterna mellan TATA och CAAT Box?
- TATA och CAAT är två regioner av nukleotider som finns i den reglerande sekvensen av eukaryota gener.
- De finns uppströms till transkriptionsinitieringsplatsen.
- Båda är konsensus-DNA-sekvenser.
- De är viktiga för reglering av transkription, så de är reglerande sekvenser.
Vad är skillnaden mellan TATA och CAAT Box?
TATA-boxen är en konserverad nukleotidregion som finns cirka 25-30 baspar uppströms till transkriptionsinitieringsstället. Å andra sidan är CAAT-box en konserverad region av nukleotider som finns omkring 75-80 baspar uppströms till transkriptionsinitieringsstället. Så detta är nyckelskillnaden mellan TATA och CAAT box. Dessutom har TATA-boxen en konsensussekvens av TATAWAW medan GGCCAATCT är konsensussekvensen för CAAT-boxen.
Dessutom är en annan signifikant skillnad mellan TATA- och CAAT-boxen att TATA-boxen tillhandahåller ett bindningsställe för TBP och transkriptionsfaktorer och deltar i transkriptionsreglering medan CAAT-boxen signalerar bindningsstället för RNA-transkriptionsfaktorn.
Nedan infographic sammanfattar skillnaderna mellan TATA och CAAT box.
Sammanfattning – TATA vs CAAT Box
TATA-box och CAAT-box är två delar av den konserverade regionen av eukaryota genpromotorer. De är belägna uppströms till transkriptionsinitieringsstället. Båda påverkar transkriptionen av gener genom att tillhandahålla platser för bindning av TATA-bindande proteiner och transkriptionsinitieringsfaktorer. TATA-boxen är belägen 25-35 baspar uppströms om transkriptionsinitieringsstället medan CAAT-boxen är belägen 75-80 baspar uppströms om transkriptionsinitieringsstället. Konsensussekvensen för TATA-boxen är TATAWAW medan konsensussekvensen för CAAT-boxen är GGCCAATCT. Det här är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan TATA och CAAT box.
