Den viktigaste skillnaden mellan länk och adapter är att en länk inte har sammanhängande ändar medan en adapter har en sammanhängande ände.
DNA-ligering är processen att sammanfoga två DNA-molekyler och bilda fosfodiesterbindningar. Enzymet som kallas DNA-ligas katalyserar denna reaktion. Det är ett av de kritiska stegen inom moderna molekylärbiologiska områden som rekombinant DNA-teknik och DNA-kloning. Ligeringseffektiviteten beror på ändarna av DNA-molekyler som ska ligeras. Det finns två typer av DNA-ändar som klibbiga ändar och trubbiga ändar. Ligeringseffektiviteten är hög med klibbiga ändar än med trubbiga ändar. Om mål-DNA-molekylerna har trubbiga ändar, kommer molekyler som kallas adaptrar eller linkers att vara användbara. Adaptrar och linkers är kemiskt syntetiserade oligonukleotidmolekyler som hjälper till vid DNA-ligering. De har också interna begränsningsplatser. Adaptern har en klibbig ände och en trubbig ände, medan linker har två trubbiga ändar.
Vad är en länkare?
Linker är en kemiskt syntetiserad oligonukleotidsekvens som är dubbelsträngad. Linker har två trubbiga ändar. Linker används för att ligera DNA-molekyler som har trubbiga ändar till vektorer. Den innehåller en eller flera interna restriktionsplatser. Dessa restriktionsplatser fungerar som igenkänningsplatser för restriktionsenzymer.
Figur 01: Linker
Efter ligering begränsas DNA igen med restriktionsenzymer för att producera kohesiva ändar. EcoRI-länkar och sal-I-länkar är vanliga länkar.
Vad är en adapter?
An Adapter är en dubbelsträngad oligonukleotidsekvens som används för att länka samman två DNA-molekyler. Det är en kort sekvens med en trubbig ände och en klibbig eller sammanhängande ände. Därför består den av en enkelsträngad svans i ena änden, vilket förbättrar effektiviteten av DNA-ligering.
Figur 02: DNA-ligering med en adapter
Dessutom har adaptern interna begränsningsplatser. Därför kan DNA efter ligering begränsas med lämpliga restriktionsenzymer för att skapa en ny utskjutande terminus. En nackdel med adaptrar är att två adaptrar kan bilda dimmers genom att basparas med sig själva. Detta kan undvikas genom att behandla dem med enzymet som kallas alkaliskt fosfatas.
Vilka är likheterna mellan länkare och adapter?
- Både linker och adapter är dubbelsträngade korta oligonukleotidsekvenser.
- De har interna begränsningswebbplatser.
- Dessutom är de kemiskt syntetiserade DNA-molekyler och är syntetiska molekyler.
- De kan länka samman två DNA-molekyler.
- Efter ligering av linkers och adaptorer begränsas DNA:t igen med restriktionsenzymer för att producera klibbiga ändar.
Vad är skillnaden mellan länkare och adapter?
En länk är en kemiskt syntetiserad kort oligonukleotidduplex med två trubbiga ändar. En adapter är en kemiskt syntetiserad kort oligonukleotidduplex med en klibbig ände och en trubbig ände. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan linker och adapter. Dessutom kan adaptrar bilda dimerer, medan linkers inte bildar dimerer. Så detta är ytterligare en betydande skillnad mellan länk och adapter.
Nedan är en sammanfattning av skillnaderna mellan linker och adapter i tabellform.
Sammanfattning – Linker vs Adaptor
Länkare och adapter är två typer av kemiskt syntetiserade oligonukleotider som är användbara för att ligera DNA med trubbiga ändar. Linker har två trubbiga ändar, medan adaptern har en trubbig ände och en sammanhängande ände. Så detta är nyckelskillnaden mellan linker och adapter. De är dubbelsträngade molekyler som har interna restriktionsställen. De används i stor utsträckning inom rekombinant DNA-teknik och DNA-kloning.
