Nyckelskillnaden mellan ORF och exon är att ORF eller den öppna läsramen är en DNA-sekvens som börjar med translationsinitieringsställe (startkodon) och slutar med translationstermineringsställe (stoppkodon) medan exon är en nukleotidsekvens i en gen som kodar för aminosyror.
En öppen läsram är en del av en läsram. Läsramar läses av ribosomer för att göra proteiner. ORF är en kontinuerlig sträcka av kodon som ger ett fullt fungerande protein. Det börjar med ett startkodon och slutar med ett stoppkodon. Inuti ORF finns det inget stoppkodon som avbryter den kodande sekvensen. Translation börjar vid startkodonet och slutar vid stoppkodonet. Exon är en nukleotidsekvens av en gen. Det kodar för aminosyror i proteinet. Därför är exoner kodande regioner av en gen.
Vad är en ORF?
Öppen läsram eller ORF är den kontinuerliga sträckan av en nukleotidsekvens som börjar med ett startkodon och slutar med ett stoppkodon. Med enkla ord hänvisar ORF till regionen av nukleotidsekvensen som är belägen mellan start- och stoppkodonen. Däremellan finns det inget stoppkodon som avbryter ORF. Nukleotidsekvensen mellan start- och stoppkodon kodar för aminosyror. I allmänhet är startkodon ATG medan stoppkodon är TAG, TAA och TGA. ORF ger ett funktionellt protein när det transkriberas och translateras. Därför inkluderar ORF ett startkodon, flera kodon i mittområdet och ett stoppkodon. Intressant nog har ORF en längd som kan delas med tre.
Figur 01: ORF
I prokaryoter, eftersom det inte finns några introner, är ORF den kodande regionen av en gen som transkriberar direkt till mRNA. I eukaryoter, eftersom det finns introner, är ORF kodonsekvensen som uppstår efter bearbetning eller RNA-splitsning. ORF är ett bevis som underlättar genförutsägelse eftersom långa ORF sannolikt är en del av en gen.
Vad är en Exon?
Exoner är de kodande nukleotidsekvenserna för gener som översätts till proteiner. De är på vardera sidan av ett intron. Efter att ha avlägsnat icke-kodande sekvenser från pre-mRNA, består den mogna mRNA-molekylen endast av exonsekvenser. Sedan omvandlas nukleotidsekvensen för den slutliga RNA-molekylen (moget mRNA) till en aminosyrasekvens av ett specifikt protein.
Figur 02: Exons
Nästan alla gener har en initial nukleotidsekvens som särskiljer den som en gen från huvud-DNA- eller RNA-strängen, som är känd som Open Reading Frame (ORF. I vissa gener markerar två ORF:er hela genen och exonerna) finns inom den kodande sekvensen. Även om det låter som att exoner alltid uttrycks i gener, finns det tillfällen där intronsekvenser intervenerar med exonet för att orsaka mutationer, och denna process kallas exonisering.
Vilka är likheterna mellan ORF och Exon?
- Både ORF och exon är nukleotidsekvenser.
- Lång ORF och exoner är delar av en gen.
- Båda har kodningssekvenser.
Vad är skillnaden mellan ORF och Exon?
ORF och exon är nukleotidsekvenser. ORF hänvisar till varje sträcka av DNA-sekvens belägen mellan ett startkodon och ett stoppkodon. Däremot är exonet en kodande nukleotidsekvens av en gen som kodar för aminosyror. Detta är alltså nyckelskillnaden mellan ORF och exon. Exoner är delar av en gen medan lång ORF sannolikt är en del av en gen. Dessutom finns det introner på båda sidor av en exon medan ORF inte inkluderar introner.
Nedan infographic sammanfattar skillnaden mellan ORF och exon i tabellform.
Sammanfattning – ORF vs Exon
Den öppna läsramen (ORF) är en del av läsramen. Det är den kontinuerliga sträckan av DNA-sekvensen som börjar med ett startkodon och slutar med ett stoppkodon. Exon är en nukleotidsekvens av en gen. Den kodar för en del av mRNA-sekvensen. Exoner är därför delar av gensekvensen som uttrycks i proteinet. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan ORF och exon.
