Nyckelskillnaden mellan dATP och ddATP är att dATP inte avslutar DNA-syntes medan ddATP kan avsluta DNA-syntes. Detta beror på att ddATP har en H-atom bunden till 3ʹ-positionen i pentossockret medan dATP har en OH-grupp bunden till 3ʹ-positionen.
dNTP är byggstenar i DNA. Det finns fyra typer av dNTP enligt purin- eller pyrimidinbaserna - dATP en av dem. Den kväveh altiga basen av dATP är adenosin. ddNTPs är nukleotider som används i Sanger-sekvensering. Det finns fyra typer av ddNTP:er. ddATP är en ddNTPs.
Vad är dATP?
Deoxiadenosintrifosfat är en nukleotid, som är en byggsten i DNA. DNA-polymerasenzym använder dATP som ett substrat för DNA-syntes. dATP har tre komponenter: en deoxiribossockermolekyl, en adenosin och de tre fosfatgrupperna. Därför är det ett purin-nukleosidtrifosfat. Den kemiska formeln för dATP är C10H16N5O12 P3, och dess molekylmassa är 491.182.
Figur 01: dATP
dATP skiljer sig från ATP (adenosintrifosfat) när det gäller sockerkomponenter. ATP har ribossocker. dATP baspar med uracilnukleotid under transkription. Förutom att delta i DNA-syntes kan dATP fungera som en energiöverförande molekyl för att upprätthålla cellviabilitet också. En hög nivå av dATP i kroppen är giftigt eftersom det kan fungera som en icke-konkurrerande hämmare för enzymet ribonukleotidreduktas. Det kan leda till nedsatt immunförsvar.
Vad är ddATP?
Dideoxyadenosintrifoafat eller ddATP är en av de fyra typerna av nukleotider som används i Sanger-sekvenseringsmetoden. Strukturellt har ddATP också tre komponenter som liknar dATP. De är en adeninbas, ett deoxiribossocker och tre fosfater.
Figur 02: ddATP
Till skillnad från dATP saknar ddATP en OH-grupp i 3'-positionen av pentossockret för att bilda fosfodiesterbindning med den intilliggande nukleotiden och fortsätta kedjeförlängningen. Den har en H-atom i 3'-position. Därför, när ddATP är införlivat, kommer DNA-syntesen till ett slut. Det är grundprincipen för Sanger-sekvensering. Därför fungerar ddATP som en kedjeförlängningshämmare i Sanger-sekvensering. Det finns fyra rör som används i Sanger-sekvensering och ddATP läggs till ett rör.
Vilka är likheterna mellan dATP och ddATP?
- dATP och ddATP är nukleotider.
- Båda är sammansatta av adenin, deoxiribos och tre fosfater.
- De är organiska föreningar.
- Både dATP och ddATP läggs till i rör i Sanger-sekvensering.
Vad är skillnaden mellan dATP och ddATP?
dATP har en OH-grupp i 3ʹ-positionen av pentossockret medan ddATP saknar en OH-grupp i 3ʹ-positionen av pentossockret. Dessutom är dATP en monomer som används i DNA-syntes medan ddATP används för att avsluta kedjeförlängning under Sanger-sekvenseringen. Så detta är nyckelskillnaden mellan dATP och ddATP. Dessutom kan dATP bilda fosfodiesterbindningar medan ddATP inte kan bilda fosfodiesterbindningar.
Infografiken nedan visar fler skillnader mellan dATP och ddATP i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – dATP vs ddATP
I korthet är dATP en föregångare till DNA-syntes medan ddATP är en nukleotid som används för att avsluta DNA-syntes i Sanger-sekvensering. Dessutom har dATP en OH-grupp i 3'-positionen av pentossocker och det tillåter bildandet av en fosfodiesterbindning med nästa nukleotid. Under tiden saknar ddATP OH-grupp i 3'-position; därför kan den inte bilda en fosfodiesterbindning med nästa nukleotid. Som ett resultat upphör DNA-sekvensen sin förlängning. Detta sammanfattar alltså skillnaden mellan dATP och ddATP.
