Nyckelskillnaden mellan VNTR och sond är att VNTR är en kort nukleotidsekvens som förekommer som en tandemupprepning i genomet medan en sond är en artificiellt syntetiserad kort sekvens av DNA eller RNA som kan märkas radioaktivt.
VNTR står för tandemupprepning med variabelt nummer. Det är en kort nukleotidsekvens organiserad i tandemupprepningar i genomet. VNTR är naturligt förekommande i vårt genom. En sond är en artificiellt syntetiserad kort DNA- eller RNA-sekvens. Både sond och VNTR är nukleinsyror eller korta nukleotidsekvenser. De har enorm användning i olika molekylärbiologiska tekniker, främst i rättsmedicinska studier. VNTR och sond delar vissa likheter såväl som skillnader. Därför försöker artikeln belysa skillnaden mellan VNTR och sond.
Vad är en VNTR?
VNTR är en kort nukleotidsekvens som existerar som en tandemupprepning i vårt genom. VNTR finns i många kromosomer. Dessutom skiljer sig VNTR:er mellan olika individer från längderna eftersom antalet upprepningar är olika i VNTR:er för olika personer. I grund och botten beror det på alleler som ärvts från sina föräldrar. Därför använder vi främst VNTR:er för föräldralegitimationer (arv) eller för personliga ändamål. På liknande sätt är det också möjligt att använda dem inom genetik, krimin alteknik, biologisk forskning och DNA-fingeravtryck. Därför är VNTR ett viktigt verktyg inom molekylärbiologi.
Figur 01: VNTR
Vid arv analyserar vi VNTR-data med hjälp av två grundläggande principer: arvsmatchning och identitetsmatchning. Under arvsmatchning måste individen ha en matchande allel till den för varje förälder. Under identitetsmatchning måste båda VNTR-allelerna finnas på en specifik plats i genomet.
Vad är en sond?
I samband med molekylärbiologi är en sond ett artificiellt syntetiserat DNA- eller RNA-fragment med en längd på 100 till 1000 baser. Vi kan radioaktivt märka dessa sonder. Därför använder vi dem för att detektera målnukleotidsekvenser som är komplementära till sekvensen för sonden. När vi lägger till prober till provet sker hybridisering med de komplementära sekvenserna eller målsekvenserna och gör det enkelt för oss att identifiera målsekvenserna. Eftersom sonder bär radioaktivitet kan vi lätt upptäcka dem.
Figur 02: Sond
Inom krimin alteknisk vetenskap använder vi vanligtvis sonder i DNA-profileringstekniker som detektering av korta tandemupprepningsregioner, restriktionsfragmentlängdspolymorfismer och DNA-fingeravtryck.
Vilka är likheterna mellan VNTR och Probe?
- Nukleinsyror är byggstenarna i VNTR och Probe.
- Vi använder dem i genidentifieringsprocesser.
- Båda deras längder är dessutom varierande.
- De är viktiga verktyg i rättsmedicinska studier, DNA-fingeravtryck, genetik, etc.
Vad är skillnaden mellan VNTR och Probe?
VNTR är en region av genomet organiserad som tandemupprepningar medan en sond är en kort DNA- eller RNA-sekvens som syntetiseras artificiellt för att detektera målsekvenser i ett prov. Så detta är nyckelskillnaden mellan VNTR och sond. En viktig skillnad mellan VNTR och sond är också att till skillnad från VNTR:er kan vi radioaktivt märka sonderna.
Dessutom utför VNTR:er mestadels föräldraidentifikationer medan sonder hjälper till att detektera målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prover som är komplementära till sekvensen för sonden. Därför är detta också en signifikant skillnad mellan VNTR och sond.
Följande infografik visar mer information om skillnaden mellan VNTR och sond.
Sammanfattning – VNTR vs Probe
Den vanliga användningen av VNTR och sond är i molekylära analystekniker som krimin altekniska studier och DNA-fingeravtryck. Båda består av varierande längder. Den viktigaste skillnaden mellan VNTR och sond är dock att en VNTR är en region av genomet arrangerad med tandemupprepningar medan en sond är ett fragment av DNA eller RNA som kan märkas radioaktivt. Dessutom finns VNTR:er i genomet. Men sönder syntetiseras artificiellt och kan märkas radioaktivt för att detektera målnukleotidsekvenser i DNA- eller RNA-prover som är komplementära till sekvensen i sonden. Detta är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan VNTR och sond.
