Nyckelskillnaden mellan Rho-beroende och Rho-oberoende terminering är att i Rho-beroende terminering binder Rho-faktorn till transkriptet och avslutar transkriptionen genom att bryta vätebindningar mellan mallen och transkriptet, medan Rho-oberoende terminering avslutar transkriptionen med producerar en hårnålsöglestruktur och sedan U-rik region i transkriptet.
Transkription är ett av de två stadierna av genuttryck. Det är processen som producerar en mRNA-sekvens från den genetiska informationen gömd i genens DNA-sekvens. Transkription sker via tre steg: initiering, förlängning och avslutning. RNA-polymerasenzym binder till genens promotorsekvens och börjar katalysera syntesen av RNA-strängen. Tills terminatorsekvensen hittas lägger RNA-polymeras till nukleotider och bygger RNA-strängen. Hos prokaryoter sker uppsägning genom två stora avslutningsstrategier: Rho-beroende uppsägning och Rho-oberoende uppsägning. Rho-faktor är ett protein som har helikasaktivitet.
Vad är Rho-beroende uppsägning?
Rho-beroende terminering är en av de två typerna av transkriptionstermineringsstrategier som förekommer i prokaryoter. Rho-faktor är ett protein som har helikasaktivitet.
Figur 01: Rho Dependent Termination
Rho-protein binder till RNA-transkriptet och rör sig längs RNA-polymeraset i 5'-3'-riktningen, vilket uppmuntrar dissociationen av vätebindningar mellan DNA-mallen och RNA-transkriptet. När Rho-faktor når transkriptionsbubblan drar den isär DNA/RNA-hybriden och frigör transkriptet från transkriptionsbubblan. När detta inträffar avslutas transkriptionen.
Vad är Rho oberoende uppsägning?
Rho-oberoende terminering är den andra strategin som avslutar prokaryotisk transkription. Vanligtvis har en terminatorregion en inverterad upprepningssekvens. Omedelbart efter den inverterade upprepade sekvensen finns det en adeninrik region (AAAA). När RNA-polymeras går framåt, producerar det en mRNA-sekvens. Eftersom de två regionerna är komplementära i den omvända upprepade sekvensregionen, bildar den en hårnålsöglestruktur på grund av vätebindning. Nästa region blir den U-rika regionen. Hårnålsstrukturen upphör RNA-polymerasaktiviteten.
Figur 02: Rho Independent uppsägning
Dessutom, i de U-rika regionerna, finns det svaga interaktioner mellan U-baser av transkript och A-baser i mallen. Dessa svaga adenin-uracilbindningar destabiliserar DNA-mallen och RNA-transkriptet och separerar varandra. I slutändan frigörs transkriptionen från transkriptionswebbplatsen.
Vilka är likheterna mellan Rho Dependent och Rho Independent uppsägning?
- Rho-beroende och Rho-oberoende terminering är två viktiga termineringsstrategier som finns i prokaryoter.
- Båda formerna frigör transkript från DNA-mallen för att avsluta transkriptionen.
Vad är skillnaden mellan Rho Dependent och Rho Independent uppsägning?
Rho-beroende terminering medieras av ett Rho-protein medan Rho-oberoende terminering sker via bildandet av en hårnålsöglestruktur. Så detta är nyckelskillnaden mellan Rho-beroende och Rho-oberoende uppsägning. Dessutom använder Rho-protein ATP-energi medan Rho-oberoende avslutning inte involverar Rho-protein och inte använder ATP-energi. Därför är detta också en betydande skillnad mellan Rho-beroende och Rho-oberoende uppsägning.
Infografiken nedan visar fler jämförelser relaterade till skillnaden mellan Rho-beroende och Rho-oberoende uppsägning.
Sammanfattning – Rho Dependent vs Rho Independent uppsägning
Rho-beroende och Rho-oberoende terminering är de två huvudsakliga transkriptionstermineringsmekanismerna som förekommer i prokaryoter. Ett Rho-protein är ansvarigt för transkriptionsavslutningen i Rho-beroende terminering. Däremot sker Rho-oberoende avslutning via en bildning av hårnålsöglestrukturen. Så detta är den viktigaste skillnaden mellan Rho-beroende och Rho-oberoende uppsägning.
