Nyckelskillnaden mellan sigma-faktor och rho-faktor är att sigma-faktor är ett protein som behövs för initiering av transkription i bakterier medan rho-faktor är ett protein som behövs för att avbryta transkription i bakterier.
Sigma-faktor och rho-faktor är två viktiga faktorer för bakteriell transkription. Bakteriell transkription är en process där en bit av bakteriellt DNA kopieras till en nytillverkad sträng av mRNA (budbärar-RNA). Denna process katalyseras av ett enzym som kallas RNA-polymeras. Bakterier är starkt beroende av transkription och översättning för att kunna reagera på sin miljö på rätt sätt. Det bakteriella RNA-polymeraset består av en kärna och en holoenzymstruktur. Kärnan innehåller underenheterna β, β′, α och 2ω medan holoenzymet innehåller sigmafaktorn. Dessutom är en sidofaktor till RNA-polymeras känd som rho-faktorn också mycket viktig för bakteriell transkription.
Vad är Sigma Factor?
Sigmafaktor eller specificitetsfaktor är ett protein som behövs för att initiera transkription i bakterier. Det är en bakteriell transkriptionsinitieringsfaktor. Denna faktor möjliggör bindning av RNA-polymerasenzym till en specifik region av DNA som kallas promotorregionen under transkription. Sigmafaktor är norm alt homolog med arkeal transkriptionsfaktor B och eukaryotisk transkriptionsfaktor TF11B. Dessutom varierar den specifika sigmafaktorn för en given gen beroende på genen och miljösignaler. Promotorerna väljs av RNA-polymeras beroende på den sigmafaktor som är associerad med den.
Figur 01: Sigma Factor
Sigmafaktorn kan också hittas i kloroplasten hos växter som en del av det plastidkodade polymeraset (PEP). Sigmafaktorn och RNA-polymeraset är tot alt känt som RNA-polymerasholoenzym. Molekylvikten för sigmafaktorn är cirka 70 kDa. Efter initieringen av transkriptionen dissocierar sigmafaktorn från komplexet. Sedan fortsätter RNA-polymeraset förlängning tills transkriptionen avslutas.
Vad är Rho-faktor?
Rho-faktor är ett prokaryotiskt protein som är involverat i avslutandet av transkription. Rho-faktor binder vanligtvis till pausstället för transkriptionsterminatorn. Detta ställe är en exponerad region av det enkelsträngade RNA:t nära den öppna läsramen vid cytosinrika guaninfattiga sekvenser. Det är ett viktigt transkriptionsprotein i prokaryoter. I Escherichia coli är rho-faktorn ungefär 274,6 kDa hexamer av identiska subenheter. Varje subenhet har en RNA-bindande domän och ATP-hydrolysdomän. Dessutom är rho-faktorns funktion helikasaktivitet.
Figur 02: Rho Factor
Rho-faktor binder till RNA-molekyl och använder sedan sin ATPas-aktivitet för att ge energi för att translokera RNA-molekyler. Rho-faktorn utför translokation tills den når RNA-DNA-helixregionen, där den lindar upp hybrid (RNA-DNA) duplexstrukturen. Denna process pausar RNA-polymeras vid termineringsstället och avslutar transkriptionsprocessen.
Vilka är likheterna mellan Sigma Factor och Rho Factor?
- Sigma-faktor och rho-faktor är två viktiga faktorer för bakteriell transkription.
- Båda finns endast i prokaryoter.
- De är proteiner som består av aminosyror.
- Båda är nukleinsyror-bindande proteiner.
- Prokaryoter är starkt beroende av dessa faktorer för att generera mRNA som kan göra speciella proteiner och hjälpa dem att reagera specifikt på sin miljö.
Vad är skillnaden mellan Sigma Factor och Rho Factor?
Sigma-faktor är ett protein som behövs för att initiera transkription i bakterier, medan rho-faktor är ett protein som behövs för att avbryta transkription i bakterier. Så detta är nyckelskillnaden mellan sigma-faktor och rho-faktor. Vidare är sigmafaktorn ett DNA-bindande protein, medan rho-faktorn är ett RNA-bindande protein.
Infografiken nedan visar skillnaderna mellan sigma-faktor och rho-faktor i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Sigma Factor vs Rho Factor
Transkription är den process där informationen i DNA kopieras till en ny molekyl som kallas mRNA (budbärar-RNA). Detta m-RNA är slutligen involverat i att producera ett specifikt protein. Sigma-faktor och rho-faktor är två viktiga faktorer för bakteriell transkription. De är proteiner. Sigmafaktor deltar i initieringen av transkription hos bakterier. Rho-faktor är ansvarig för avbrytandet av transkription i bakterier. Detta är alltså sammanfattningen av skillnaden mellan sigma-faktor och rho-faktor.
