Transposon vs Retrotransposon
Transposoner och retrotransposoner är genetiska komponenter i DNA, och det finns stora skillnader mellan dem. Den procentuella närvaron av dessa genetiska material varierar mellan arter, och deras funktioner bestämmer organismens öden med mutationer och andra fenotypiskt viktiga förändringar. Transposoner och retrotransposoner är gener eller samlingar av vissa gener som finns i DNA-strängarna, och förändringar av deras placering har varit de främsta orsakerna till dessa konsekvenser. Den här artikeln avser dock att kortfattat diskutera dessa geners funktioner och presenterar en jämförelse mellan transposoner och retrotransposoner.
Vad är Transposon?
Transposoner är intressanta fragment eller segment av DNA med förmågan att ändra placeringen av DNA-strängen i form av klipp- och klistramekanism. På grund av transposonernas mobila natur är dessa kända som hoppgener. Transposoner är av två huvudtyper som kallas klass I-transposoner och klass II-transposoner. Vanligtvis hänvisas till klass II-typen som transposonerna och klass I-typen hänvisas till som retrotransposonerna. Processerna för att klippa och klistra av mobila DNA-segment regleras av enzymet transposas. Enzymet binder till de båda ändarna av transposonet och skär av fosfodiesterbindningarna i DNA-strängen, isolerar transposonet, flyttar det till målstället och binder på den nya platsen. Denna process är dock intressant att förstå, eftersom vissa transposoner endast kan flytta till vissa platser endast på grund av inkompatibiliteten hos bassekvenser med målstället. Gener med ena änden av en enkelsträng har samma bassekvens som den andra änden av den andra enkelsträngen är transposoner med klibbiga kanter, eftersom de kan binda till platserna för mål-DNA-strängen med samma bassekvens som i de klibbiga ändarna. Emellertid kan denna geners rörlighet orsaka förändringar av genotypen såväl som i organismens fenotyp. Forskare som uppfann transposonerna och genetiskt modifierade livsmedel och organismer enligt de föredragna anpassningarna gjordes sedan tillgängliga. Högproduktiva jordbruksgrödor, antibiotika med medicinska egenskaper, boskapsdjur var några av de fördelaktigt utvecklade produkterna efter uppfinningen av transposoner av Barbara McClintock på 1940-talet.
Vad är retrotransposon?
Retrotransposoner är klass I-transposoner, och dessa rör sig genom genomet genom mekanismen för kopiering och inklistring. Mekanismen för retrotransposonernas rörlighet involverar några större steg, såsom kopiering av gensegmentet av DNA-strängen till RNA, överföring av kopian av RNA till målplatsen, transkription av RNA-sekvensen tillbaka till DNA med omvänt transkriptas och insättning av genen till den nya platsen för DNA-strängen av genomet. De två ändarna av dessa retrotransposoner har vanligtvis långa terminala upprepningar med cirka 1000 baspar, och de används som identifieringsegenskaper för dessa gener. Dessa gener kan lätt amplifieras inuti genomet, och andelen retrotransposoner i det mänskliga genomet är cirka 50 %. Dessa kan vara ganska farliga eftersom det orsakande viruset av AIDS, HIV och T-cellsleukemivirus har retrotransposonerna i sina RNA-genom. Faktum är att dessa virus kan binda retrotransposonerna till vilken plats som helst av de mänskliga DNA-strängarna med användning av omvänt transkriptas och integras. Integrasenzymet fungerar på samma sätt som transposas i klass II-transposoner.
Vad är skillnaden mellan Transposon och Retrotransposon?
• Transposoner är klass II hoppande gener medan retrotransposoner faller i kategorin klass I.
• Transposoner fungerar med transposasenzymet medan retrotransposoner fungerar med användning av två huvudenzymer som kallas omvänt transkriptas och integras.
• Terminaländarna är mycket längre i retrotransposoner än i transposoner.
• Transposoner klipps ut från ursprunget och klistras in vid målet; omvänt kopieras retrotransposoner från ursprunget till RNA och transkriberas vid målet.
• Förflyttning av retrotransposoner involverar RNA men inte i transposoner.
