Den viktigaste skillnaden mellan klass I och klass II transposerbara element är att klass I transposerbara element är retrotransposoner, medan klass II transposerbara element är DNA transposoner.
Ett transposerbart element är en DNA-sekvens som kan ändra sin position i genomet. Ibland skapar och vänder det mutationer. Det kan också förändra cellens genetiska identitet och genomstorlek. Denna process resulterar ofta i duplicering av samma genetiska material. Det transponerbara elementet upptäcktes först av Barbara McClintock och hon vann Nobelpriset för sin upptäckt 1983. Transponerbara element kan kategoriseras i två klasser baserat på deras transponeringsmekanism: klass I och klass II transponerbara element.
Vad är klass I-transponerbara element?
Klass I-transposerbara element är retrotransposoner. Retrotransposon är en typ av genetisk komponent som kopierar och klistrar in sig på olika genomiska platser genom att omvandla RNA tillbaka till DNA genom en process som kallas omvänd transkription. Denna process katalyseras av enzymet omvänt transkriptas. Retrotransposon använder norm alt en RNA-transpositionsintermediär. Klass I-transponerbara element kopieras vanligtvis i två steg. Först transkriberas de från DNA till RNA. Sedan transkriberas det producerade RNA:t till DNA. Senare infogas detta kopierade DNA tillbaka i genomet på en ny position. Egenskaperna hos retrotransposoner är mycket lika retrovirus som HIV.
Figur 01: Transposerbart element av klass I
Retrotransposoner kan delas in i tre typer.
- Retrotransposoner med långa terminala upprepningar (LTR), som kodar för omvänt transkriptas,
- Retrotransposoner med långa interspersed nukleära element (LINE) som kodar för omvänt transkriptas men saknar LTR och transkriberas av RNA-polymeras II,
- Retrotransposoner med korta interspersed nukleära element (SINEs) som inte kodar för omvänt transkriptas och transkriberas av RNA-polymeras III.
Dessutom, på grund av en liknande mekanism med retrotransposoner, kan retrovirus också betraktas som transposerbara element.
Vad är klass II-transposerbara element?
Transposerbara klass II-element är DNA-transposoner. Klass II-transposerbara element har en klipp- och klistratranspositionsmekanism som inte involverar en RNA-mellanprodukt. Transpositionen katalyseras av flera transposasenzymer. Dessa enzymer kan specifikt eller icke-specifikt binda till DNA:t. Transposas gör ett förskjutet snitt vid målstället för DNA som producerar klibbiga ändar. Sedan klipper dessa ut DNA-transposonligater till andra målplatser.
Figur 02: Transposerbara element av klass II
Vanligtvis fyller DNA-polymeras ut de resulterande luckorna från klibbiga ändar, och DNA-ligas stänger socker-fosfatryggraden. Dessutom resulterar denna transponering i målplatsduplicering. Insättningsställena för DNA-transposoner kan identifieras genom korta, direkta upprepningar följt av inverterade upprepningar. Men inte alla DNA-transposoner visar en klipp- och klistratranspositionsmekanism. Till exempel visar vissa transposoner replikativ transponering där transposoner replikerar sig själva till en ny målplats.
likheter mellan klass I och klass II transponerbara element
- Transposerbara klass I och klass II element är mobila genetikelement eller hoppgener.
- Båda kan ändra sin position i genomet.
- De består av DNA-sekvenser.
- De är själviska genetiska element.
- De är mycket viktiga för genomisk funktion och evolution.
Skillnaden mellan klass I och klass II transponerbara element
Klass I-transposerbara element är retrotransposoner, medan klass II-transposerbara element är DNA-transposoner. Så detta är nyckelskillnaden mellan klass I och klass II transponerbara element. Dessutom använder klass I-transposerbara element RNA-intermediärer i transpositionsmekanismen. Å andra sidan använder klass II transposerbara element DNA-intermediärer i transpositionsmekanismen.
Följande infografik sammanställer skillnaderna mellan klass I och klass II transponerbara element i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Klass I vs Klass II Transposable Elements
Transposerbara element är kända som mobila genetiska element eller hoppande gener. De är DNA-sekvenser. Transponerbara element kategoriseras i två klasser baserat på deras införlivande mekanism som klass I och klass II transponerbara element. Klass I-transposerbara element är retrotransposoner, medan klass II-transposerbara element är DNA-transposoner. Detta är alltså den viktigaste skillnaden mellan klass I och klass II transponerbara element.
