Key Difference – YAC vs BAC Vectors
Vektorer används vid molekylär kloning. En vektor kan definieras som en DNA-molekyl som beter sig som en vehikel för att bära främmande genetiskt material in i en annan cell. En vektor som innehåller främmande DNA är känd som rekombinant DNA och den bör ha förmågan att replikera och uttrycka den i värdorganismen. Jäst artificiell kromosom (YAC) och bakteriell artificiell kromosom (BAC) är två typer av vektorer involverade i kloning. Den viktigaste skillnaden mellan YAC och BAC är att YAC är ett artificiellt konstruerat vektorsystem som använder en specifik region av jästkromosomen för att infoga stora segment av genetiskt material till jästceller medan BAC är ett artificiellt konstruerat vektorsystem som använder en specifik region av E.coli-kromosom för att infoga stora segment av DNA i E. coli-celler.
Vad är YAC-vektorer?
YAC (Yeast artificiell kromosom) är en artificiellt byggd kromosom som har förmågan att bära ett stort segment av främmande DNA och replikera i jästcellerna. Den har en centromer, telomerer samt autonomt replikerande sekvenser som är väsentliga för replikation och stabilitet. YAC bör också bära en eller flera selektiva markörer och restriktionsställen för att göra den till en effektiv kloningsvektor. En stor sekvens som sträcker sig från 1000 kb till 2000 kb kan infogas i YAC och överföras till jäst. Omvandlingseffektiviteten för YAC är mycket låg.
Figur 01: YAC Vector
Vad är BAC-vektorer?
Bakteriell artificiell kromosom (BAC) är en artificiellt konstruerad kromosom för molekylär kloning. Den har specifika regioner av E. coli F-plasmid och den är cirkulär och superlindad. BAC utvecklas för att klona DNA-fragment till bakterier, speciellt till E. coli. Den kan bära DNA-fragment med storlekar upp till 300 kb. Jämfört med YAC är BAC-kloningsinlägg mindre i storlekar. BACs utvecklades 1992 och det är fortfarande populärt på grund av dess stabilitet och enkla konstruktion. BAC är också användbara för att utveckla vacciner.
Figur 02: BAC-vektor i molekylär kloning
Vad är skillnaden mellan YAC- och BAC-vektorer?
YAC vs BAC Vectors |
|
| YAC är en genetiskt modifierad kromosom med användning av jäst-DNA för kloningsändamål. | BAC är en genetiskt modifierad DNA-molekyl som använder E. coli-DNA för kloningsändamål. |
| Kön | |
| YACs designades för att klona stora fragment av genomiskt DNA till jäst. | BAC utvecklades för kloning av stora genomiska fragment i Escherichia coli. |
| Infoga längd | |
| YAC kan innehålla genomiska inlägg i megabasstorlek.(1000 kb – 2000 kb). | BACs kan bära insatser på 200–300 kb eller mindre. |
| Construction | |
| YAC-DNA är svårt att rena intakt och kräver hög koncentration för att generera YAC-vektorsystem. | BAC är lätt att rena intakt och kan enkelt konstrueras. |
| chimerism | |
| YACs är ofta chimära. | BAC är sällan chimära. |
| Stabilitet | |
| YAC är instabil. | BAC är stabil. |
| Ändringar | |
| Jästrekombination är mycket genomförbart och förblir alltid aktiv. Därför kan den generera borttagningar och andra omarrangemang i en YAC. | E. coli-rekombination förhindras och aktiveras vid behov. Därför minskar det oönskade omarrangemang i BAC. |
| Underhåll | |
| Manipulation av rekombinanta YAC kräver vanligtvis att YAC överförs till E. coli för efterföljande manipulation. Därför är det en mödosam process. | BAC-modifiering sker direkt i E. coli. Så det finns inget behov av DNA-överföring. Därför är processen inte mödosam. |
Sammanfattning – YAC vs BAC Vectors
YAC har blivit ett viktigt forskningsverktyg i kloningsprocesser på grund av dess förmåga att klona stora fragment av DNA in i värdorganismen. YACs har dock flera nackdelar som vektorer såsom konstruktionssvårigheter, chimerism, instabilitet, etc. För att övervinna dessa problem har forskare därför utvecklat BAC-vektorer. BAC har konstruerats med användning av specifika regioner av E. coli-kromosomen. Det är en stabil vektor och kan lätt konstrueras. Längden på DNA som BAC kan hantera är dock upp till 20 gånger mindre än YAC. Detta är skillnaden mellan YAC och BAC vektorsystem. Nuförtiden är BAC mer föredraget framför YAC i labbet.
