Den viktigaste skillnaden mellan xylencyanol och bromfenolblått är att i 1 % agarosgel migrerar xylencyanol långsammare, medan bromfenolblått migrerar snabbare.
Xylencyanol och bromfenolblått är viktiga som färgmarkörer som kan användas för att övervaka processen för agarosgelelektrofores och polyakrylamidgelelektrofores.
Vad är xylencyanol?
Xylenecyanol är en elektroforetisk färgmarkör eller ett spårningsfärgämne. Det är användbart för att övervaka processen för agarosgelelektrofores och polyakrylamidgelelektrofores. När detta ämne blandas med provet blir koncentrationen av detta ämne vanligtvis cirka 0.005 % till 0,03 %. Några synonymer som vi kan använda för xylencyanol inkluderar Acid Blue 147, xylencyanol, xylencyanol FF, xylencyanol FF, etc.
Den kemiska formeln för denna förening är C25H27N2NaO 6S2 Molmassan för xylencyanol är 538,61 g/mol. Denna substans kan migrera med en hastighet av cirka 4 – 5 kilobaspars DNA-fragment i 1 % agarosgeler. Detta beror dock på vilken buffert vi använder. Typiskt kan xylencyanol på 6 % polyakrylamidgel migrera med en hastighet av cirka 140 baspars DNA-fragment. Å andra sidan kan den migrera i 20 % denaturerande polyakrylamidgelelektrofores med en hastighet av 25 baser oligonukleotid.
Antalet vätebindningsgivare för xylencyanol är 2m och antalet vätebindningsacceptorer är 8. Antalet roterbara bindningar för denna förening kan anges som 7. Xylencyanols komplexitet kan beskrivas som 1120 grader. Den har ett definierat bindningsstereocenterantal på 1.
Vad är bromofenolblått?
Bromfenolblått är en användbar pH-indikator som är användbar som en elektroforetisk färgmarkör och ett färgämne. Den har det kemiska namnet 3', 3", 5', 5"-tetrabromfenolsulfonftalein, BPB. Den kemiska formeln för denna förening är C19H10Br4O5 S. Molmassan av denna förening är 669,96 g/mol. Det är luktfritt och dess densitet kan anges som 2,2 g/ml. Dess smältpunkt är 273 grader Celsius, och dess kokpunkt är 279 grader Celsius. Vi kan förbereda det genom att långsamt tillsätta överskott av brom till en het lösning av fenolsulfonftalein i isättika.
Bromfenolblått är användbart som en syra-basindikator i intervallet mellan pH 3,0 till 4,6. Den kan ändras från gul vid pH 3,0 till pH 4,6. Dessutom är det en reversibel reaktion. Strukturellt liknar bromfenolblått fenolftalein.
Dessutom kan vi använda den som en färgmarkör för att övervaka processen för agarosgelelektrofores och polyakrylamidgelelektrofores. Detta ämne kan bära en negativ laddning vid måttligt pH, där det kan migrera i samma riktning som DNA eller protein i en gel. Migrationshastigheten kan variera beroende på geldensitet och buffertsammansättning. I en typisk 1 % agarosgel i engångs-TAE-buffert eller TBE-buffert migrerar emellertid detta ämne i samma hastighet som ett DNA-fragment på cirka 300 baspar.
Vad är skillnaden mellan xylencyanol och bromfenolblått?
Xylencyanol och bromfenolblått är viktiga färgmarkörer. Den viktigaste skillnaden mellan xylencyanol och bromfenolblått är att i 1 % agarosgel migrerar xylencyanol långsammare, medan bromfenolblått migrerar snabbare.
Nedan är en sammanfattning av skillnaden mellan xylencyanol och bromfenolblått i tabellform för jämförelse sida vid sida.
Sammanfattning – Xylene Cyanol vs Bromophenol Blue
Xylencyanol och bromfenolblått är viktiga som färgmarkörer som används för att övervaka processen för agarosgelelektrofores och polyakrylamidgelelektrofores. Den viktigaste skillnaden mellan xylencyanol och bromfenolblått är att i 1 % agarosgel migrerar xylencyanol långsammare medan bromfenolblått migrerar snabbare.
